More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1305 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  100 
 
 		 444 aa  876    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  63.72 
 
 		 435 aa  533  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  63.64 
 
 		 433 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  65.63 
 
 		 438 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  65.63 
 
 		 438 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  64.81 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  62.47 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  62.47 
 
 		 500 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  62.16 
 
 		 433 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  62.47 
 
 		 444 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  62.47 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  62.47 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  62.47 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  62.47 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  62.47 
 
 		 500 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  62 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  62.26 
 
 		 436 aa  503  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  62 
 
 		 500 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  62 
 
 		 501 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  62 
 
 		 500 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  62 
 
 		 500 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  62 
 
 		 500 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  61.52 
 
 		 503 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  61.52 
 
 		 497 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  58.16 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  59.38 
 
 		 502 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  67.8 
 
 		 449 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  59.14 
 
 		 499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  60.14 
 
 		 445 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  63.68 
 
 		 442 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  61.96 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  63.44 
 
 		 442 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  58.65 
 
 		 433 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  59.1 
 
 		 459 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  58.11 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  60.96 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  61.73 
 
 		 445 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  63.37 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  56.39 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  54.74 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  55.97 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  56.01 
 
 		 436 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  54.95 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  61.89 
 
 		 443 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  57.08 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  54.94 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  53.69 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  53.69 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  54.95 
 
 		 437 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  61.17 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  61.17 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  53.22 
 
 		 445 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  56.59 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  50.66 
 
 		 500 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  55.17 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  55.95 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  51.08 
 
 		 506 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  57.42 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  49.78 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  52.75 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  53.13 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  51.43 
 
 		 498 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  52.75 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  51.44 
 
 		 498 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  49.78 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  52.88 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  47.57 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  50.11 
 
 		 498 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  51.38 
 
 		 494 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  54.98 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  53.99 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  54.07 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  53.9 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  52.76 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  51.62 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  52.64 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  56.22 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  54.57 
 
 		 482 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  53.88 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  51.62 
 
 		 513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  54.89 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2734  ammonium transporter  49.69 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  51.06 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  50.22 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  49.77 
 
 		 515 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  49.66 
 
 		 524 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  53.3 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  48.85 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  50.23 
 
 		 510 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  52.87 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  54.5 
 
 		 461 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  52 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  52.2 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  49.66 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  49.27 
 
 		 431 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  50.58 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  54.26 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  49.76 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  46.96 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  47.8 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>