More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0046 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  79.49 
 
 		 431 aa  691    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  100 
 
 		 429 aa  828    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  71.36 
 
 		 438 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  63.81 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  54 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  55.05 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0641  ammonium transporter  57.14 
 
 		 416 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.117335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  55.69 
 
 		 434 aa  438  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  54.97 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  55.22 
 
 		 467 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  56.19 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  53.9 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  51.6 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  53.76 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  53.38 
 
 		 410 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  53.86 
 
 		 410 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  53 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  54.59 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  53.38 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  53.38 
 
 		 410 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  53.38 
 
 		 410 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  53.38 
 
 		 410 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  53.38 
 
 		 410 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  55.01 
 
 		 431 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  53.14 
 
 		 410 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  53.38 
 
 		 410 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  52.61 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  52.05 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  51.24 
 
 		 398 aa  385  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  51.46 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  51.85 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  53.68 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  51.36 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  51.11 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  52.08 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  51.46 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  49.75 
 
 		 402 aa  378  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  51.45 
 
 		 406 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  49.88 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  49.64 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  49.88 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  49.88 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  49.64 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  49.64 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  49.64 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  50.12 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  49.88 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  49.28 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  51.07 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  49.88 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  49.88 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  50.99 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  49.88 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  49.88 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  51.72 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  49.64 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  48.96 
 
 		 437 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  49.27 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  49.64 
 
 		 502 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  51.84 
 
 		 433 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  50.71 
 
 		 463 aa  362  7.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  46.92 
 
 		 494 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  49.76 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  48.84 
 
 		 437 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  48.61 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  48.61 
 
 		 437 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  49.76 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  48.83 
 
 		 488 aa  359  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  48.38 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  54.59 
 
 		 468 aa  358  8e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  47.55 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  47.52 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  49.41 
 
 		 489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  51.27 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  49.88 
 
 		 449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  48.17 
 
 		 513 aa  356  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  45.85 
 
 		 477 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  48.56 
 
 		 466 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  47.71 
 
 		 510 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  48.15 
 
 		 466 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  49.27 
 
 		 453 aa  353  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  48.15 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  50.71 
 
 		 474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  44.86 
 
 		 499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  55.5 
 
 		 449 aa  353  5e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  49.39 
 
 		 452 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  47.59 
 
 		 436 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  50 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  49.27 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  46.57 
 
 		 436 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  50.69 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  46.39 
 
 		 498 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  46.67 
 
 		 507 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  49.64 
 
 		 503 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  49.64 
 
 		 497 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  46.39 
 
 		 498 aa  350  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  44.64 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  50.7 
 
 		 442 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  50.93 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  47.44 
 
 		 476 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>