More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0641 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0641  ammonium transporter  100 
 
 		 416 aa  813    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.117335  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  57.14 
 
 		 429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  58.05 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  53.7 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  52.74 
 
 		 428 aa  408  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  46.17 
 
 		 436 aa  352  8e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  47 
 
 		 434 aa  348  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  46.8 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  49.02 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  45.76 
 
 		 444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  45.84 
 
 		 451 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  45.86 
 
 		 457 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  44.2 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  44.55 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  44.55 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  44.55 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  44.55 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  44.55 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  46.78 
 
 		 461 aa  331  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  44.31 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  44.55 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  44.31 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  44.55 
 
 		 428 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  42.79 
 
 		 428 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  42.79 
 
 		 428 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  42.79 
 
 		 428 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  42.79 
 
 		 428 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  44.44 
 
 		 433 aa  328  9e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  42.92 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  43.72 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  43.24 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  45.52 
 
 		 434 aa  322  6e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  42.34 
 
 		 445 aa  322  7e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  45 
 
 		 463 aa  322  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  43.46 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  42.33 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  44.97 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  44.97 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  44.97 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  45.06 
 
 		 467 aa  319  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  45.71 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  42.82 
 
 		 513 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  44.85 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  44.85 
 
 		 466 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  44.85 
 
 		 478 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  47.1 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  44.85 
 
 		 500 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  44.42 
 
 		 466 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  44.85 
 
 		 466 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  42.09 
 
 		 515 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  44.85 
 
 		 466 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  44.85 
 
 		 500 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  44.42 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  43.44 
 
 		 437 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  44.85 
 
 		 501 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  44.68 
 
 		 437 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  42.72 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  45.08 
 
 		 466 aa  315  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  44.85 
 
 		 469 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  42.13 
 
 		 524 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  42.09 
 
 		 510 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  43.44 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  44.85 
 
 		 500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  44.85 
 
 		 500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  44.85 
 
 		 500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  43.2 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  44.9 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  42.33 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  44.52 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  45.45 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  44.72 
 
 		 398 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  44.12 
 
 		 500 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  44.1 
 
 		 504 aa  312  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  43.71 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  40.92 
 
 		 499 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0694  ammonium transporter  44.5 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  40.13 
 
 		 498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  42.29 
 
 		 477 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  42.12 
 
 		 432 aa  307  3e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2864  ammonium transporter  43.37 
 
 		 430 aa  305  8.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.962346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  45.08 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3056  ammonium transporter  42.56 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  46.42 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  46.42 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  45.48 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  40.35 
 
 		 498 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  44.39 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  40.61 
 
 		 500 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  43.66 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  44.63 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  44.15 
 
 		 411 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  44.53 
 
 		 433 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  42.68 
 
 		 400 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  40.35 
 
 		 498 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  44.39 
 
 		 410 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  44.39 
 
 		 410 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  46.45 
 
 		 468 aa  302  7.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  39.91 
 
 		 506 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  45.77 
 
 		 445 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  44.29 
 
 		 442 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>