More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0377 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  100 
 
 		 433 aa  850    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  61.43 
 
 		 431 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  61 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  61 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  61 
 
 		 500 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  61 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  61 
 
 		 500 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  61.76 
 
 		 438 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  61 
 
 		 444 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  61 
 
 		 478 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  61.76 
 
 		 438 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  60.77 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  60.29 
 
 		 500 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  59.57 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  59.57 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  59.57 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  59.33 
 
 		 501 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  59.57 
 
 		 504 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  59.81 
 
 		 499 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  59.09 
 
 		 502 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  59.62 
 
 		 444 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  59.57 
 
 		 497 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  59.57 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  53.96 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  55.2 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  64.22 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  54.76 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  53.58 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  56.87 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  56.83 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  56.04 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  55.2 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  53.24 
 
 		 499 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  52.78 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  57.52 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  52.86 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  53.15 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  52.68 
 
 		 510 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  52.15 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  54.73 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  51.98 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  51.85 
 
 		 524 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  52.07 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  52.94 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  53.38 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  51.09 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  53.06 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0473  ammonium transporter  54.69 
 
 		 522 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  52.86 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  57.49 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  57.14 
 
 		 444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  55.98 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  52.88 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  52.68 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  55.74 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0172  putative ammonium transporter transmembrane protein  53.29 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17564  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  50.46 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  52.12 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  50.12 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  51.24 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  50.99 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  51.24 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  51.73 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  51.24 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  56.23 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  51.24 
 
 		 428 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  51.73 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  55.22 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  51.73 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  49.55 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  51.73 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  50.49 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  50.99 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  51.24 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  51.73 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  51.24 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0121  ammonium transporter  53.09 
 
 		 521 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0596893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  55.74 
 
 		 445 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  49.56 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  56.8 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  51.24 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  49.56 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  52.62 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  49.12 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  54.21 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  55.28 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  56.48 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  52.18 
 
 		 480 aa  395  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  52.07 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  52.66 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  56.48 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  50.81 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  52.07 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  48.28 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  49.12 
 
 		 500 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  55.72 
 
 		 468 aa  388  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  50.86 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  50.23 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  52.07 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1110  ammonium transporter  51.83 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0348758  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>