More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0959 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  93.76 
 
 
433 aa  754    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  100 
 
 
433 aa  847    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1824  ammonium transporter  73.21 
 
 
359 aa  555  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  63.64 
 
 
444 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  63.61 
 
 
466 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  63.61 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  63.61 
 
 
466 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  63.61 
 
 
478 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  63.92 
 
 
431 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  63.61 
 
 
466 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  63.61 
 
 
500 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  63.61 
 
 
500 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  63.37 
 
 
469 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  62.86 
 
 
504 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  62.03 
 
 
436 aa  495  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  61.93 
 
 
500 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  61.93 
 
 
500 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  61.93 
 
 
500 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  61.93 
 
 
500 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  62.44 
 
 
438 aa  488  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  62.44 
 
 
438 aa  488  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  62.41 
 
 
502 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  60.52 
 
 
463 aa  481  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  62.17 
 
 
499 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  59.76 
 
 
501 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  62.62 
 
 
503 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  62.62 
 
 
497 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  60.05 
 
 
459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  58.95 
 
 
435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  61.59 
 
 
445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  66.91 
 
 
449 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  63.1 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  63.22 
 
 
442 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  62.19 
 
 
444 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  62.95 
 
 
438 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  56.58 
 
 
461 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  62.74 
 
 
442 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  64.27 
 
 
445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  55.36 
 
 
434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  63.33 
 
 
443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  51.43 
 
 
499 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  63.81 
 
 
443 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  55.64 
 
 
457 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  63.81 
 
 
443 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  51.88 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  56.7 
 
 
431 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  56.97 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  52.32 
 
 
500 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  54.5 
 
 
433 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  55.4 
 
 
428 aa  431  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  51.63 
 
 
498 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  53.77 
 
 
432 aa  433  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  54.92 
 
 
436 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  53.38 
 
 
441 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  51.54 
 
 
498 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  52.43 
 
 
498 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  49.67 
 
 
500 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  53.86 
 
 
477 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  55.16 
 
 
443 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  53.29 
 
 
476 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  52.87 
 
 
437 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  52.63 
 
 
437 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  52.39 
 
 
437 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  50.22 
 
 
506 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  50.66 
 
 
480 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  55.39 
 
 
436 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  57.14 
 
 
427 aa  419  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  53.6 
 
 
437 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  53.81 
 
 
445 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  54.11 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  52.14 
 
 
466 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  51.74 
 
 
432 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  54.67 
 
 
449 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  50.54 
 
 
480 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  52.14 
 
 
466 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  50.81 
 
 
466 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  49.89 
 
 
494 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  54.27 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  53.32 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  56.01 
 
 
433 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  54.08 
 
 
461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  53.07 
 
 
449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  50.81 
 
 
436 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  50.93 
 
 
499 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  53.29 
 
 
472 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  52.05 
 
 
429 aa  405  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  50.34 
 
 
524 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  50 
 
 
480 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  52.49 
 
 
480 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  54.52 
 
 
468 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  53.9 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  50.35 
 
 
515 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2251  ammonium transporter  54.43 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.163851 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  51.58 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  53.94 
 
 
480 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2208  ammonium transporter  48.89 
 
 
498 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  51.35 
 
 
452 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  52.33 
 
 
439 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  53.06 
 
 
454 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  51.95 
 
 
438 aa  394  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>