More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3048 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  100 
 
 		 405 aa  804    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  70.79 
 
 		 405 aa  567  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  62 
 
 		 457 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  62.34 
 
 		 467 aa  501  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  60.15 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  64.6 
 
 		 402 aa  498  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  61.94 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  58.97 
 
 		 451 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  65.59 
 
 		 402 aa  481  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  64.6 
 
 		 401 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  60.99 
 
 		 464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  58.85 
 
 		 461 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  57.36 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  55.42 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  55.17 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  55.42 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  55.42 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  55.17 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  59.9 
 
 		 401 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  55.42 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  55.17 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  54.93 
 
 		 410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  54.43 
 
 		 410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  56.76 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  54.09 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  54.46 
 
 		 408 aa  425  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  54.21 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  54.46 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  49.38 
 
 		 406 aa  421  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  51.6 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  54.36 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  55.31 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  50.87 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  53.2 
 
 		 438 aa  401  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  50.5 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  54.57 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  53.2 
 
 		 438 aa  401  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  52.83 
 
 		 504 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  52.24 
 
 		 402 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  51.4 
 
 		 489 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  52.58 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  51.34 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  51.34 
 
 		 478 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  51.34 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  51.34 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  51.34 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  50.25 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  52.58 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  52.58 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  52.58 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  51.34 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  51.34 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  51.11 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  50.71 
 
 		 488 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  51.34 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  52.39 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  52.33 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  51.48 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  51.25 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  53.04 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  50.74 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  49.39 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  48.03 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  53.96 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  50.47 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  50.25 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  47.91 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  51.82 
 
 		 502 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  50.62 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  50.12 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  50 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  49.06 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  49.08 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  48.15 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  50.37 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  49.06 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  50.38 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  49.54 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  51.3 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  48.05 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  52.09 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  52.09 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  49.08 
 
 		 515 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  50.61 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  50.37 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  48.16 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  49.08 
 
 		 524 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  48.29 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  52.4 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  48.6 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  52.1 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  49.51 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  48 
 
 		 398 aa  368  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  48.28 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  49.26 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  47.66 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  50.83 
 
 		 459 aa  364  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  47.93 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  50.25 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1110  ammonium transporter  50.25 
 
 		 428 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0348758  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>