More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0157 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  100 
 
 		 405 aa  808    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  62.87 
 
 		 405 aa  459  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  48.15 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  46.67 
 
 		 410 aa  362  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  47.19 
 
 		 467 aa  362  6e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  47.16 
 
 		 410 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  46.67 
 
 		 410 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  46.91 
 
 		 410 aa  359  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  46.08 
 
 		 411 aa  359  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  46.91 
 
 		 410 aa  358  7e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  46.42 
 
 		 410 aa  358  9e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  46.67 
 
 		 410 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  45.93 
 
 		 410 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  44.8 
 
 		 457 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  46.15 
 
 		 433 aa  354  1e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  46.19 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  45.95 
 
 		 461 aa  346  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  48.03 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31514  Amt family transporter: ammonium  45.83 
 
 		 418 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  45.07 
 
 		 462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  43.73 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  45.68 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  45.57 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  45.45 
 
 		 434 aa  335  7e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2140  ammonium transporter  46.88 
 
 		 438 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  43.38 
 
 		 406 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  45.16 
 
 		 436 aa  332  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  44.64 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  42.12 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  43.6 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  44.69 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  44.96 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  46.23 
 
 		 466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  46.23 
 
 		 466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  46.23 
 
 		 500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  46.23 
 
 		 466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  46.23 
 
 		 500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  45.68 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  46.23 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  46.23 
 
 		 478 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  45.1 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  42.62 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  43.06 
 
 		 515 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  45.1 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  44.69 
 
 		 408 aa  326  6e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  44.85 
 
 		 437 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  45.74 
 
 		 504 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  45.74 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  43.06 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  43.24 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  45.99 
 
 		 500 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  45.99 
 
 		 500 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  45.99 
 
 		 500 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  45.99 
 
 		 500 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  44.88 
 
 		 466 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  44.5 
 
 		 466 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  42.35 
 
 		 488 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  42 
 
 		 397 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  44.88 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  43.24 
 
 		 428 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  45.04 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  45.04 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  42.75 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  42.96 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  44.44 
 
 		 408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  42.08 
 
 		 398 aa  319  6e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  44.34 
 
 		 496 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1461  ammonium transporter  44.23 
 
 		 412 aa  318  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1299  ammonium transporter  44.23 
 
 		 412 aa  318  9e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.421181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  44.63 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  42.68 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  45.26 
 
 		 499 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  45.01 
 
 		 501 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  45.74 
 
 		 431 aa  316  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  42.15 
 
 		 489 aa  315  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  44.42 
 
 		 435 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  43.88 
 
 		 436 aa  314  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  42.72 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  42.82 
 
 		 485 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  44.12 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  41.38 
 
 		 431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  41.79 
 
 		 462 aa  312  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5122  ammonium transporter  43.98 
 
 		 412 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  42.38 
 
 		 521 aa  311  1e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  41.79 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  43.52 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  44.17 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  44.53 
 
 		 431 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  43.8 
 
 		 502 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  44.67 
 
 		 423 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  43.21 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  42.47 
 
 		 494 aa  309  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1679  ammonia permease  41.69 
 
 		 448 aa  309  4e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  42.49 
 
 		 507 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  43.46 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  43.17 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  41.98 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  45.58 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1347  ammonium transporter  43.35 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  43.35 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>