More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2140 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2140  ammonium transporter  100 
 
 		 438 aa  856    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  60.93 
 
 		 462 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  58.94 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1347  ammonium transporter  62.53 
 
 		 442 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  58.2 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0443  ammonium transporter  60.38 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  60.34 
 
 		 442 aa  455  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1337  ammonium transporter  57.11 
 
 		 460 aa  438  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  49.26 
 
 		 449 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  49.4 
 
 		 467 aa  356  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  48.25 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  46.88 
 
 		 405 aa  341  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  49.02 
 
 		 434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  49.63 
 
 		 470 aa  338  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  50 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  47.28 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  48.48 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  48.51 
 
 		 411 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  48.15 
 
 		 410 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  48.14 
 
 		 410 aa  335  9e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  48.15 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  45.64 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  48.76 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  47.9 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  46.06 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  48.68 
 
 		 472 aa  333  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  47.9 
 
 		 410 aa  333  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  47.9 
 
 		 410 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  45.45 
 
 		 451 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  45.91 
 
 		 406 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  47.65 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  47.9 
 
 		 410 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  48.51 
 
 		 408 aa  331  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  46.72 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  49.88 
 
 		 408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  47.2 
 
 		 485 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  46.26 
 
 		 515 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  46.5 
 
 		 515 aa  325  9e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  46.62 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  46.34 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  47.15 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  45.69 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  45.69 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  46.54 
 
 		 466 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  46.54 
 
 		 466 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  46.54 
 
 		 466 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  46.54 
 
 		 500 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  46.54 
 
 		 500 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  46.54 
 
 		 444 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  46.54 
 
 		 478 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  45.26 
 
 		 504 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.14 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  46.3 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  46.55 
 
 		 398 aa  319  7e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  45.37 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  44.77 
 
 		 431 aa  316  7e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  47.5 
 
 		 405 aa  316  7e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  46.19 
 
 		 427 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  45.58 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  45.82 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  45.58 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  45.58 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  46.31 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  45.79 
 
 		 507 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  44.66 
 
 		 431 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  44.47 
 
 		 501 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  46.68 
 
 		 499 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  45.34 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  46.48 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  45.82 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  46.34 
 
 		 502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  44.2 
 
 		 433 aa  308  9e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.26 
 
 		 496 aa  308  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  45.32 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  48.14 
 
 		 402 aa  307  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  45.61 
 
 		 436 aa  305  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  46.21 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  47.41 
 
 		 455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  45.32 
 
 		 411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  44.9 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  46.53 
 
 		 432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  44.72 
 
 		 438 aa  302  7.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  43.58 
 
 		 449 aa  302  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  43.35 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04231  hypothetical protein  45.19 
 
 		 449 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  45.81 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  46.25 
 
 		 411 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  43.03 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  44.34 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  44.91 
 
 		 402 aa  301  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  45.39 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  43.91 
 
 		 474 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  47.54 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  44.58 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1679  ammonia permease  43.49 
 
 		 448 aa  297  3e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  43.98 
 
 		 477 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  45.41 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  43.55 
 
 		 494 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  44.63 
 
 		 459 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  44.15 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>