More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1679 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1679  ammonia permease  100 
 
 
448 aa  897    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1412  ammonium transporter  54.5 
 
 
393 aa  385  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  48.77 
 
 
413 aa  355  8.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  45.81 
 
 
411 aa  341  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  45.81 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  45.22 
 
 
457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  43.03 
 
 
410 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  44.02 
 
 
444 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  44.02 
 
 
478 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  44.02 
 
 
500 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  44.02 
 
 
466 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  44.2 
 
 
435 aa  331  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  44.02 
 
 
466 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  44.02 
 
 
466 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  44.02 
 
 
500 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  44.02 
 
 
500 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  43.78 
 
 
500 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  43.78 
 
 
500 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  43.78 
 
 
500 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  44.02 
 
 
469 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  45.57 
 
 
434 aa  329  6e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  43.87 
 
 
438 aa  329  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  43.87 
 
 
438 aa  329  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  42.72 
 
 
411 aa  328  9e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  45.3 
 
 
453 aa  328  9e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  43.03 
 
 
410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  43.65 
 
 
504 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  43.03 
 
 
410 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  44.58 
 
 
467 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  44.09 
 
 
410 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  42.79 
 
 
410 aa  326  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  42.79 
 
 
410 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.58 
 
 
462 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  44.09 
 
 
410 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  42.55 
 
 
410 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  42.33 
 
 
451 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  44.39 
 
 
428 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  42.82 
 
 
501 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  44.64 
 
 
428 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  44.64 
 
 
428 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  44.64 
 
 
428 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  47.03 
 
 
431 aa  322  7e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  44.64 
 
 
428 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  46.15 
 
 
430 aa  322  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  46.15 
 
 
430 aa  322  9.000000000000001e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  46.15 
 
 
430 aa  322  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  42.36 
 
 
444 aa  319  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  43.67 
 
 
428 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  43.67 
 
 
428 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  43.67 
 
 
428 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  43.67 
 
 
428 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  43.92 
 
 
428 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  43.46 
 
 
405 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  43.67 
 
 
428 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  43.42 
 
 
428 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  43.42 
 
 
428 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  43.67 
 
 
428 aa  316  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  43.4 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  43.46 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0776  ammonia permease  43.73 
 
 
398 aa  315  1.9999999999999998e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  44.09 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  40.43 
 
 
463 aa  312  7.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  44.61 
 
 
429 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  43.54 
 
 
503 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  43.03 
 
 
436 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  43.54 
 
 
497 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  42.89 
 
 
453 aa  309  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  41.69 
 
 
405 aa  309  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  42.69 
 
 
499 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  42.58 
 
 
427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  43.73 
 
 
430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  43.73 
 
 
428 aa  309  8e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  40.79 
 
 
431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  42.69 
 
 
502 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  43.1 
 
 
438 aa  306  6e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  41.59 
 
 
445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  42.08 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  41.09 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  42.51 
 
 
464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  41.28 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  44.17 
 
 
462 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  42.08 
 
 
433 aa  302  9e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  40.9 
 
 
459 aa  302  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  41.23 
 
 
452 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  42.36 
 
 
406 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  41.98 
 
 
449 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  45.59 
 
 
402 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  41.49 
 
 
432 aa  300  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  44.53 
 
 
455 aa  300  5e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  42.47 
 
 
405 aa  299  7e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  40.93 
 
 
436 aa  299  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  42.86 
 
 
437 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  42.51 
 
 
466 aa  296  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  42.86 
 
 
437 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  43.14 
 
 
433 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  42.62 
 
 
437 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  43.24 
 
 
466 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  42.27 
 
 
466 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  42.29 
 
 
432 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  40.63 
 
 
461 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>