More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5122 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1299  ammonium transporter  92.23 
 
 		 412 aa  715    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.421181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5122  ammonium transporter  100 
 
 		 412 aa  819    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1461  ammonium transporter  92.23 
 
 		 412 aa  715    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.3 
 
 		 449 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  44.36 
 
 		 405 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  43.8 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  44.04 
 
 		 410 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  47.42 
 
 		 451 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  43.55 
 
 		 410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31514  Amt family transporter: ammonium  45.41 
 
 		 418 aa  325  7e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  43.55 
 
 		 410 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  43.55 
 
 		 410 aa  325  9e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  45.19 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  43.31 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  46.94 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  43.31 
 
 		 410 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  43.55 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  43.31 
 
 		 410 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  44.42 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  45.21 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  47.69 
 
 		 411 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  45.97 
 
 		 467 aa  319  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  45.19 
 
 		 457 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  42.75 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  45.2 
 
 		 405 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.12 
 
 		 462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  45.04 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  44.72 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  46.29 
 
 		 402 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  45.24 
 
 		 515 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  44.68 
 
 		 515 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  44.36 
 
 		 443 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0212  ammonium transporter  44.7 
 
 		 507 aa  298  8e-80  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  43.14 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  45.32 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  41.79 
 
 		 402 aa  296  6e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  44.83 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  45.32 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  43.1 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  45.7 
 
 		 469 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  44 
 
 		 496 aa  292  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  45.48 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  45.45 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  44.98 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  45.45 
 
 		 444 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  43.18 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  45.45 
 
 		 478 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  45.45 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  45.45 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  45.45 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  45.45 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  45.69 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  42.13 
 
 		 427 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  41.22 
 
 		 438 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  44.25 
 
 		 437 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  44.55 
 
 		 488 aa  289  8e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  43.46 
 
 		 437 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  44.96 
 
 		 499 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  43.76 
 
 		 507 aa  288  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  44.31 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  41.91 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  46.19 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  42.99 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  44.55 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  43.46 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  42.43 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  43.46 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  43.24 
 
 		 501 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  45.26 
 
 		 485 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  42.89 
 
 		 474 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  43.93 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  41.97 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  45.7 
 
 		 502 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  42.37 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  45.54 
 
 		 454 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  43.32 
 
 		 466 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  43.32 
 
 		 466 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  43.32 
 
 		 466 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  44.92 
 
 		 397 aa  285  9e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  41.81 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  44.72 
 
 		 504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0213  ammonium transporter  44.66 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  44.72 
 
 		 500 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  44.72 
 
 		 500 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  44.72 
 
 		 500 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  42.92 
 
 		 472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  44.72 
 
 		 500 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  42.61 
 
 		 456 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  42.05 
 
 		 394 aa  282  8.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  41.67 
 
 		 436 aa  282  8.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  40.29 
 
 		 429 aa  282  8.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  44.69 
 
 		 439 aa  282  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  41.95 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  43.42 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  41.49 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  41.98 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  45.57 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  42.01 
 
 		 464 aa  280  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  42.61 
 
 		 401 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  42.11 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>