More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0212 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0212  ammonium transporter  100 
 
 
507 aa  1012    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0213  ammonium transporter  75.55 
 
 
520 aa  743    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  43.75 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1299  ammonium transporter  46.27 
 
 
412 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.421181  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1461  ammonium transporter  46.27 
 
 
412 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5122  ammonium transporter  44.44 
 
 
412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  40.8 
 
 
432 aa  282  9e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31514  Amt family transporter: ammonium  41.03 
 
 
418 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  40.94 
 
 
405 aa  277  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  37.16 
 
 
406 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  37.14 
 
 
451 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  38.88 
 
 
469 aa  270  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  41.67 
 
 
405 aa  269  8e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  37.15 
 
 
467 aa  269  8.999999999999999e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  38.64 
 
 
500 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  38.64 
 
 
500 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  38.64 
 
 
444 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  38.64 
 
 
466 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  38.64 
 
 
478 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  38.64 
 
 
466 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  38.64 
 
 
466 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  41.67 
 
 
449 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  40.88 
 
 
437 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  38.99 
 
 
436 aa  266  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  38.34 
 
 
445 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  39.17 
 
 
504 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  40.36 
 
 
431 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  39.9 
 
 
500 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  39.9 
 
 
500 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  39.9 
 
 
500 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  40.05 
 
 
432 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  38.44 
 
 
444 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  40.74 
 
 
437 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  37.91 
 
 
457 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  40.74 
 
 
437 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  40.74 
 
 
437 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  39.66 
 
 
500 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  38.76 
 
 
466 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  39.04 
 
 
466 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  40.37 
 
 
405 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  39.41 
 
 
433 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  37.73 
 
 
443 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  38.76 
 
 
466 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  39.72 
 
 
462 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  39.91 
 
 
429 aa  259  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  40.94 
 
 
478 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  40.47 
 
 
456 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  38.85 
 
 
453 aa  256  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  37.56 
 
 
434 aa  256  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  38.65 
 
 
501 aa  256  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  37.13 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  38.16 
 
 
435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  38.9 
 
 
402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  38.17 
 
 
502 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  37.7 
 
 
429 aa  254  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  39.62 
 
 
397 aa  254  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  38.65 
 
 
442 aa  253  7e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  38.03 
 
 
499 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  39.47 
 
 
402 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  37.56 
 
 
515 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  38.66 
 
 
461 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  36.9 
 
 
431 aa  250  4e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  38.13 
 
 
496 aa  250  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  35.97 
 
 
410 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  35.97 
 
 
410 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  37.92 
 
 
433 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  36.3 
 
 
411 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  36.04 
 
 
410 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  38.32 
 
 
462 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  37.95 
 
 
438 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  37.95 
 
 
438 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  35.97 
 
 
410 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  37.53 
 
 
489 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  35.12 
 
 
410 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  35.75 
 
 
410 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  36.73 
 
 
513 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  36.14 
 
 
438 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  37.33 
 
 
515 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  35.35 
 
 
410 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  38.11 
 
 
428 aa  247  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  35.07 
 
 
410 aa  248  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  38.23 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  38.02 
 
 
463 aa  246  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2140  ammonium transporter  38.52 
 
 
438 aa  246  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  35.33 
 
 
467 aa  246  8e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  39.9 
 
 
503 aa  246  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  39.9 
 
 
497 aa  246  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  37.3 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  40.58 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  37.23 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  35.84 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  36.76 
 
 
521 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  37.79 
 
 
474 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  38.22 
 
 
464 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  38.39 
 
 
434 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  37.1 
 
 
427 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  35.84 
 
 
510 aa  243  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  35.4 
 
 
515 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2309  ammonium transporter  39.28 
 
 
437 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  37.41 
 
 
507 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>