More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2309 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2309  ammonium transporter  100 
 
 		 437 aa  853    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  49.4 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  49.88 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  48.79 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  49.28 
 
 		 432 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  48.01 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  48.01 
 
 		 437 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  50 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  50.12 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  47.54 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  48.26 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  47.79 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  47.54 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  47.79 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0694  ammonium transporter  49.63 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  47.75 
 
 		 435 aa  360  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  48.91 
 
 		 449 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  45.43 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  46.74 
 
 		 477 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  47.21 
 
 		 476 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  48.53 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  48.53 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  44.57 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  43.84 
 
 		 499 aa  348  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  45.05 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  46.22 
 
 		 513 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  47.2 
 
 		 500 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  47.2 
 
 		 500 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  47.2 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  47.2 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  47.2 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  47.2 
 
 		 444 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  47.2 
 
 		 478 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  46.96 
 
 		 469 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  47.92 
 
 		 504 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  46.33 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  46.4 
 
 		 472 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  45.04 
 
 		 500 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  44.12 
 
 		 452 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  41.75 
 
 		 498 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  46.54 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  46.94 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  46.94 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  46.94 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  45.98 
 
 		 436 aa  339  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  42.89 
 
 		 500 aa  339  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  42.45 
 
 		 500 aa  339  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  42.48 
 
 		 498 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  46.9 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  46 
 
 		 524 aa  338  8e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  48.91 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  41.48 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  45.29 
 
 		 510 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  45.98 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  46.76 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  46.45 
 
 		 500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  45.5 
 
 		 501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  46.23 
 
 		 502 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  44.44 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  47.06 
 
 		 480 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  45.52 
 
 		 431 aa  330  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2251  ammonium transporter  44.66 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  44.08 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  45.26 
 
 		 499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3051  ammonium transporter  45.28 
 
 		 451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  46.84 
 
 		 454 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  46.59 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  46.78 
 
 		 468 aa  326  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  41.06 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0268  ammonium transporter  42.96 
 
 		 431 aa  325  7e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  45.58 
 
 		 459 aa  325  9e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  45.94 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  41.61 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  41.61 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  42.99 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  41.84 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  41.61 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  41.61 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  45.82 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  45.58 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1122  ammonium transporter  46.72 
 
 		 483 aa  323  4e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.909008  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  42.99 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  40.13 
 
 		 506 aa  323  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  46.65 
 
 		 445 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  42.07 
 
 		 428 aa  322  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  46.87 
 
 		 433 aa  322  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  45.81 
 
 		 457 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  46.91 
 
 		 457 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  43.54 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  47.43 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  47.43 
 
 		 497 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  42.35 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1088  ammonium transporter  45.99 
 
 		 484 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.149046  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  47.72 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  42.12 
 
 		 428 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  42.12 
 
 		 428 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  42.12 
 
 		 428 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  42.12 
 
 		 428 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  42.12 
 
 		 428 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  43.62 
 
 		 515 aa  318  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>