More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2232 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  100 
 
 
394 aa  763    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  53.86 
 
 
445 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  54.35 
 
 
431 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  52.88 
 
 
437 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  52.4 
 
 
437 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  52.07 
 
 
432 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  52.64 
 
 
437 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  52.64 
 
 
437 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  51.08 
 
 
466 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  51.08 
 
 
466 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  50.84 
 
 
466 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2309  ammonium transporter  50 
 
 
437 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  50.36 
 
 
436 aa  365  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  48.77 
 
 
444 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  48.04 
 
 
504 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  49.15 
 
 
436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  47.3 
 
 
466 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  47.3 
 
 
500 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  47.3 
 
 
500 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  47.3 
 
 
466 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  47.3 
 
 
466 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  47.3 
 
 
444 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  47.3 
 
 
478 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  47.55 
 
 
469 aa  349  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  47.55 
 
 
500 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  46.73 
 
 
434 aa  348  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  47.55 
 
 
500 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  47.55 
 
 
500 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  47.3 
 
 
500 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  46.8 
 
 
431 aa  342  7e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  48.8 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  45.59 
 
 
499 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  46.32 
 
 
502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  47.13 
 
 
433 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  47.36 
 
 
461 aa  336  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  45.91 
 
 
438 aa  335  7.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  47.19 
 
 
438 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  47.19 
 
 
438 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  46.25 
 
 
410 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  45.59 
 
 
501 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  48.09 
 
 
442 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  46.6 
 
 
452 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  48.04 
 
 
497 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  48.04 
 
 
503 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  47.85 
 
 
442 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  48.33 
 
 
444 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  46 
 
 
410 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  46 
 
 
410 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  45.16 
 
 
443 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  43.85 
 
 
477 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  45.76 
 
 
410 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  46.51 
 
 
454 aa  328  7e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  48.11 
 
 
443 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  48.11 
 
 
443 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  45.76 
 
 
410 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  44.25 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  45.85 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  45.66 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  45.41 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  45.52 
 
 
410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  46.19 
 
 
435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  47.96 
 
 
443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  48.47 
 
 
445 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  45.28 
 
 
410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  45.23 
 
 
466 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  43.62 
 
 
476 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  45.28 
 
 
410 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  48 
 
 
445 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  47.5 
 
 
433 aa  323  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  45.05 
 
 
463 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  40.43 
 
 
506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  46.7 
 
 
482 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  44.01 
 
 
436 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  44.93 
 
 
441 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  47.17 
 
 
467 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3051  ammonium transporter  45.84 
 
 
451 aa  319  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  44.01 
 
 
515 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  46.53 
 
 
457 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32601  Amt family transporter: ammonium  47.55 
 
 
530 aa  317  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000576108  normal  0.0348473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  44.01 
 
 
524 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0120  ammonium transporter  45.52 
 
 
450 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  43.35 
 
 
432 aa  315  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  48.54 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  46.31 
 
 
446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0888  ammonium transporter  43.41 
 
 
450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2546  ammonium transporter  43.41 
 
 
450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  41.45 
 
 
500 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  45.26 
 
 
451 aa  311  9e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  42.53 
 
 
513 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  43.52 
 
 
405 aa  311  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  44.63 
 
 
428 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  41.27 
 
 
467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  43.9 
 
 
433 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  41.1 
 
 
498 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  45.52 
 
 
434 aa  308  8e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  41.1 
 
 
498 aa  308  8e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  40.79 
 
 
500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  40.13 
 
 
499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  46.91 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  46.91 
 
 
461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>