More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0490 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  100 
 
 		 431 aa  839    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0268  ammonium transporter  61.14 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  51.89 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  53.79 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  52.4 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  50.82 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  50.23 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  50.23 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  50 
 
 		 437 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  51.84 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  50 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  49.64 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  48.93 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  48.93 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  50.62 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  52.7 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  52.7 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  49.27 
 
 		 444 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  46.4 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  48.39 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  50.73 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  50.73 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  50.73 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  50.73 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  50.73 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  50.49 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  50.73 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  50.73 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  49.75 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  49.88 
 
 		 504 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  50.61 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  47.41 
 
 		 498 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2309  ammonium transporter  49.88 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  50.36 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  50.36 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  47.81 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  50.36 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  49.76 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  48.66 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  49.88 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  46.49 
 
 		 498 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  50.58 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  50.48 
 
 		 445 aa  358  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  43.98 
 
 		 499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  47.97 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  43.11 
 
 		 500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  50.49 
 
 		 503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  50.49 
 
 		 497 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  43.11 
 
 		 500 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  43.54 
 
 		 500 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  47.38 
 
 		 466 aa  354  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  45.77 
 
 		 436 aa  353  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  47 
 
 		 436 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  45.17 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  48.93 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  44.85 
 
 		 524 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  44.93 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  44.95 
 
 		 515 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  46.43 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  43.71 
 
 		 513 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  48.46 
 
 		 442 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  40.86 
 
 		 506 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  45.26 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  45.06 
 
 		 499 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  43.93 
 
 		 477 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  50.48 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  46.47 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  46.9 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  49.54 
 
 		 445 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  45.37 
 
 		 452 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  46.55 
 
 		 433 aa  342  5e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  47.2 
 
 		 482 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  45.61 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  43.58 
 
 		 510 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  42.86 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  43.69 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  46.4 
 
 		 457 aa  339  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  48.34 
 
 		 446 aa  338  8e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  49.52 
 
 		 443 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  46.72 
 
 		 468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  41.94 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  49.62 
 
 		 433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  45.41 
 
 		 427 aa  336  5e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  48.26 
 
 		 444 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  43.16 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  43.16 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  43.16 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2734  ammonium transporter  43.63 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  49.76 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  49.76 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  43.9 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  41.86 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  45.5 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  45.32 
 
 		 449 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  41.63 
 
 		 428 aa  332  8e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  41.63 
 
 		 428 aa  332  8e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  41.63 
 
 		 428 aa  332  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  41.63 
 
 		 428 aa  332  8e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3051  ammonium transporter  45.74 
 
 		 451 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  41.63 
 
 		 428 aa  332  8e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>