More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0268 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0268  ammonium transporter  100 
 
 		 431 aa  835    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  61.14 
 
 		 431 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  49.03 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  49.41 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  49.41 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  48.71 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  49.18 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  50.36 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  48.58 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  47.82 
 
 		 466 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  47.82 
 
 		 466 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  48.06 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  48.53 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  46.78 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  45.35 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  46.19 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  46.19 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  43.73 
 
 		 461 aa  349  4e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  45.07 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  45.54 
 
 		 438 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  42.82 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  44.71 
 
 		 500 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  44.82 
 
 		 504 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  43.8 
 
 		 435 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  44.47 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  44.47 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  44.47 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  44.96 
 
 		 445 aa  338  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  43.47 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  43.27 
 
 		 466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  43.27 
 
 		 466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  43.27 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  43.27 
 
 		 478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  43.51 
 
 		 469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  43.27 
 
 		 500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  43.51 
 
 		 499 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  43.27 
 
 		 466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  43.27 
 
 		 500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  46.14 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  43.27 
 
 		 501 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  46.56 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  43.27 
 
 		 502 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  45.06 
 
 		 503 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  45.06 
 
 		 497 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  45.23 
 
 		 433 aa  333  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  45.86 
 
 		 442 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  43.41 
 
 		 452 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  45.86 
 
 		 442 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  42.99 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  41.67 
 
 		 441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  40.31 
 
 		 499 aa  326  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  44.92 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  39.7 
 
 		 506 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  40.18 
 
 		 500 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2309  ammonium transporter  42.96 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  45.28 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  43.57 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  42.36 
 
 		 513 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  42.59 
 
 		 515 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  42.59 
 
 		 524 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  41.23 
 
 		 498 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  43.83 
 
 		 454 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  41.5 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  45.52 
 
 		 443 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  45.52 
 
 		 443 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  41.53 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  41.9 
 
 		 510 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  45.78 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  40.29 
 
 		 427 aa  315  8e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  42.13 
 
 		 436 aa  315  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  41.95 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  39.43 
 
 		 500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  42.18 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  44.58 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  42.29 
 
 		 443 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  39.91 
 
 		 498 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  42.18 
 
 		 430 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3051  ammonium transporter  43.66 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2734  ammonium transporter  40.27 
 
 		 509 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  39.46 
 
 		 494 aa  310  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  41.28 
 
 		 480 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  39.43 
 
 		 500 aa  309  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  42.82 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  41.35 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  41.35 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  40.95 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  40.1 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  40.95 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  41.35 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  44.79 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  41.54 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  41.29 
 
 		 428 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  40.69 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  41.29 
 
 		 428 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  41.29 
 
 		 428 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  41.29 
 
 		 428 aa  306  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  41.54 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  41.29 
 
 		 428 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  41.29 
 
 		 428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  40.71 
 
 		 428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>