More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32601 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_32601  Amt family transporter: ammonium  100 
 
 
530 aa  1046    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000576108  normal  0.0348473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  48.09 
 
 
466 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  48.06 
 
 
466 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  51.81 
 
 
437 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  51.93 
 
 
437 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  52.01 
 
 
445 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  51.54 
 
 
432 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  51.93 
 
 
437 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  50.23 
 
 
466 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  52.17 
 
 
437 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  50.24 
 
 
445 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  50.46 
 
 
438 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  51.46 
 
 
436 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  51.15 
 
 
444 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  48.14 
 
 
438 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  50.12 
 
 
442 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  48.14 
 
 
438 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  49.65 
 
 
442 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  52.18 
 
 
443 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  50.61 
 
 
500 aa  360  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  48.31 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  50.36 
 
 
500 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  50.36 
 
 
500 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  50.36 
 
 
500 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  51.5 
 
 
445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  49.15 
 
 
501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  49.88 
 
 
500 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  45.95 
 
 
444 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  49.88 
 
 
466 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  51.67 
 
 
445 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  49.88 
 
 
504 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  49.88 
 
 
500 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  49.88 
 
 
466 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  49.88 
 
 
466 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  51.94 
 
 
443 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  49.88 
 
 
444 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  49.88 
 
 
478 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  51.94 
 
 
443 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  49.39 
 
 
469 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  46.3 
 
 
441 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  46.87 
 
 
477 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  48.07 
 
 
452 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  47.34 
 
 
431 aa  348  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  46.17 
 
 
476 aa  346  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  46.78 
 
 
441 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  48.18 
 
 
499 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  46.07 
 
 
431 aa  341  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  47.94 
 
 
502 aa  339  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  50.61 
 
 
497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  50.61 
 
 
503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  47.8 
 
 
394 aa  337  5e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  45.83 
 
 
434 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  45.48 
 
 
435 aa  333  4e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  48.37 
 
 
433 aa  333  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  45.13 
 
 
443 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  46.34 
 
 
436 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  42.92 
 
 
461 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2251  ammonium transporter  47.17 
 
 
434 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.163851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  42.54 
 
 
500 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  45.84 
 
 
436 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  42.83 
 
 
498 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0694  ammonium transporter  46.38 
 
 
452 aa  324  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  47.49 
 
 
454 aa  324  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  45.15 
 
 
432 aa  323  4e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  42.61 
 
 
499 aa  323  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  44.69 
 
 
449 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  48.93 
 
 
433 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3051  ammonium transporter  47.62 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  45 
 
 
433 aa  319  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  45.65 
 
 
472 aa  319  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  42.7 
 
 
498 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0120  ammonium transporter  45.67 
 
 
450 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  43.59 
 
 
467 aa  316  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  44.25 
 
 
480 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0888  ammonium transporter  45.67 
 
 
450 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2546  ammonium transporter  45.67 
 
 
450 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  41.46 
 
 
494 aa  312  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  42.48 
 
 
498 aa  312  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  42.82 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  45 
 
 
430 aa  310  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  42.37 
 
 
513 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  42.45 
 
 
463 aa  310  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  42.37 
 
 
510 aa  309  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  45.28 
 
 
480 aa  309  9e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  41.57 
 
 
524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  41.91 
 
 
515 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  44.76 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2032  ammonium transporter  44.21 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.482356  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  40.09 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  40.56 
 
 
500 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  44.75 
 
 
499 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  44.82 
 
 
449 aa  306  8.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  40.95 
 
 
480 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  43.33 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2734  ammonium transporter  42.74 
 
 
509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  39.91 
 
 
500 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  45.21 
 
 
457 aa  303  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  42.67 
 
 
480 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  46.32 
 
 
433 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  45.1 
 
 
439 aa  302  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>