More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2272 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  100 
 
 		 467 aa  942    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  49.76 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  46.8 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  46.8 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  48.39 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  47.46 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  46.65 
 
 		 504 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  46.79 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  46.06 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  46.79 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  46.79 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  46.79 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  46.79 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  49.4 
 
 		 467 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  46.56 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  46.79 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  46.24 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  46.79 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  45.54 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  45.54 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  48.84 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  45.54 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  48.01 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  45.48 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  45.31 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  49.05 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  46.89 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  46.53 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  49.16 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  47.14 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  46.32 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  45.77 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  45.75 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  47.98 
 
 		 497 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  47.98 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  48.29 
 
 		 445 aa  362  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  46.32 
 
 		 502 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  46.51 
 
 		 433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  45.87 
 
 		 461 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  46.28 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  46.34 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  47.22 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  46.9 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.21 
 
 		 496 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  43.97 
 
 		 452 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  47.56 
 
 		 515 aa  349  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  43.71 
 
 		 466 aa  349  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  44.5 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  46.17 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  44.93 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  44.63 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  46.41 
 
 		 405 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  46.85 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  47.79 
 
 		 444 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  46.41 
 
 		 410 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  46.19 
 
 		 410 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  46.41 
 
 		 410 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  46.41 
 
 		 410 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  47.79 
 
 		 443 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  46.19 
 
 		 410 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  46.15 
 
 		 442 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  46.17 
 
 		 411 aa  345  8e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  44.04 
 
 		 436 aa  345  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  46.01 
 
 		 437 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  46.17 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  44.24 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  46.19 
 
 		 515 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  45.77 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  46.17 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  46.76 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  45.18 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  45.18 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  46.28 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  44.86 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  47.14 
 
 		 405 aa  343  4e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  48.02 
 
 		 443 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  43.3 
 
 		 524 aa  343  5e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  48.02 
 
 		 443 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  45.54 
 
 		 437 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  46.77 
 
 		 470 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  47.62 
 
 		 402 aa  342  7e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  43.81 
 
 		 515 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  48.57 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  44.26 
 
 		 443 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  41.79 
 
 		 500 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  46.4 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3051  ammonium transporter  44.91 
 
 		 451 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  41.45 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  47.55 
 
 		 438 aa  340  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  42.6 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  47.62 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  45.24 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  45.92 
 
 		 470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  43.91 
 
 		 449 aa  335  7e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  46.41 
 
 		 445 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  42.66 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  41.14 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  42.66 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  42.52 
 
 		 406 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  45.58 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>