More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1461 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1299  ammonium transporter  100 
 
 		 412 aa  820    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.421181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1461  ammonium transporter  100 
 
 		 412 aa  820    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5122  ammonium transporter  92.23 
 
 		 412 aa  715    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.91 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  44.72 
 
 		 405 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  47.29 
 
 		 451 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  44.23 
 
 		 410 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  46.29 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  43.98 
 
 		 411 aa  328  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  46.81 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  44.53 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  47.78 
 
 		 467 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  43.49 
 
 		 410 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  43.73 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  43.73 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  43.73 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  47.19 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  45.43 
 
 		 457 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31514  Amt family transporter: ammonium  45.27 
 
 		 418 aa  323  3e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  43.95 
 
 		 410 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  44.33 
 
 		 406 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  43.49 
 
 		 410 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  43.49 
 
 		 410 aa  322  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  44.85 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  46.96 
 
 		 411 aa  319  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  44.47 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  47.51 
 
 		 515 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.96 
 
 		 462 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  46.35 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  46.65 
 
 		 402 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  43.92 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  44.89 
 
 		 398 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  45.11 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  43.58 
 
 		 427 aa  305  7e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  46.21 
 
 		 489 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  45.41 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  46.17 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  46.79 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0212  ammonium transporter  46.52 
 
 		 507 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  46.17 
 
 		 408 aa  302  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  45.41 
 
 		 507 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  46.56 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  45.93 
 
 		 408 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  46.79 
 
 		 485 aa  299  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  46.56 
 
 		 401 aa  298  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  43.32 
 
 		 453 aa  298  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  46.15 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  45.57 
 
 		 469 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  44.69 
 
 		 437 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  43.14 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  45.32 
 
 		 500 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  45.32 
 
 		 500 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  45.32 
 
 		 466 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  45.32 
 
 		 466 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  45.32 
 
 		 466 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  45.32 
 
 		 444 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  45.32 
 
 		 478 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  44.44 
 
 		 437 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  44.2 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  41.91 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  44.2 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  42.03 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  44.42 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  45.07 
 
 		 499 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  45.81 
 
 		 502 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  43.95 
 
 		 466 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  45.29 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  44.83 
 
 		 501 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  44.83 
 
 		 504 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  43.7 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  44.64 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  41.75 
 
 		 427 aa  293  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  43.95 
 
 		 466 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  42.89 
 
 		 444 aa  292  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  42.44 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  44.83 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  43.1 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  44.83 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  44.83 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  42.96 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  43.61 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  44.83 
 
 		 500 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  41.97 
 
 		 442 aa  289  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  42.09 
 
 		 431 aa  288  9e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  41.56 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  42.23 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  42.54 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  41.55 
 
 		 431 aa  288  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  43.7 
 
 		 401 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  44.12 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0213  ammonium transporter  45.51 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2140  ammonium transporter  43.86 
 
 		 438 aa  286  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  42.46 
 
 		 435 aa  285  8e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  42.21 
 
 		 478 aa  285  9e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  43.45 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  42.54 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  41.67 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  43.45 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  41.83 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  44.2 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>