More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0158 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  100 
 
 		 397 aa  775    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  55 
 
 		 489 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  53.94 
 
 		 515 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  53.7 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  53.7 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  53.22 
 
 		 485 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  53.43 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  54.25 
 
 		 496 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  57.25 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  54.01 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  52.23 
 
 		 444 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  53.25 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  55.15 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  52.45 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  54.34 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  52.85 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  52.85 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  51 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  51.08 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  51.11 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  51.88 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  52.51 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  50.49 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  50.25 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  50.86 
 
 		 500 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  51.11 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  48.64 
 
 		 427 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  50.37 
 
 		 500 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  50.37 
 
 		 500 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  50.37 
 
 		 500 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  50.23 
 
 		 436 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  49.39 
 
 		 469 aa  362  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  52.46 
 
 		 408 aa  362  9e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  50.24 
 
 		 444 aa  362  9e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  50 
 
 		 405 aa  362  9e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  52.22 
 
 		 408 aa  361  1e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  49.88 
 
 		 500 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  49.88 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  49.88 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  49.88 
 
 		 500 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  49.88 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  49.88 
 
 		 444 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  49.88 
 
 		 478 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  49.88 
 
 		 453 aa  361  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  49.01 
 
 		 405 aa  360  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  49.53 
 
 		 515 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  48.03 
 
 		 410 aa  359  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  52.22 
 
 		 408 aa  359  4e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  50.87 
 
 		 433 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1999  ammonium transporter  51.21 
 
 		 444 aa  358  6e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  49.53 
 
 		 524 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  48.03 
 
 		 410 aa  358  8e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  47.78 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  48.28 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0094  ammonium transporter  51.46 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.162623  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2672  ammonium transporter  51.42 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000545054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  51.62 
 
 		 402 aa  356  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  48.29 
 
 		 411 aa  356  5e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  47.78 
 
 		 410 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  47.78 
 
 		 410 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  51.37 
 
 		 464 aa  355  7.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  49.75 
 
 		 437 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04231  hypothetical protein  50.49 
 
 		 449 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  49.14 
 
 		 501 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0089  ammonium transporter  50 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  50 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  49.75 
 
 		 437 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  48.2 
 
 		 463 aa  354  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  49.51 
 
 		 429 aa  354  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  47.54 
 
 		 410 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  48.74 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  49.51 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  48.01 
 
 		 410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  49.75 
 
 		 437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  49.13 
 
 		 428 aa  352  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  49.75 
 
 		 432 aa  352  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  49.14 
 
 		 467 aa  352  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0566  ammonium transporter  47.57 
 
 		 427 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0404362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  50.99 
 
 		 438 aa  352  8e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  48.26 
 
 		 513 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  46.4 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  46.23 
 
 		 397 aa  351  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  48.56 
 
 		 466 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  49.5 
 
 		 431 aa  349  4e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  48.14 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  47.91 
 
 		 445 aa  348  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  49.53 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  51.35 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  47.56 
 
 		 510 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  47.91 
 
 		 466 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  50.24 
 
 		 445 aa  345  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  48.15 
 
 		 499 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  47.91 
 
 		 466 aa  345  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  46.77 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  49.75 
 
 		 433 aa  344  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  51.21 
 
 		 438 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  47.26 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  50.86 
 
 		 503 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  50.86 
 
 		 497 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  47.67 
 
 		 466 aa  343  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>