More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0086 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0089  ammonium transporter  84.23 
 
 		 443 aa  730    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1999  ammonium transporter  88.92 
 
 		 444 aa  723    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0094  ammonium transporter  87.39 
 
 		 443 aa  744    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.162623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  100 
 
 		 444 aa  882    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2672  ammonium transporter  87.39 
 
 		 443 aa  745    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000545054  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0128  ammonium transporter  74.89 
 
 		 441 aa  623  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0306677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0107  ammonium transporter  73.2 
 
 		 444 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0566  ammonium transporter  66.59 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0404362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  50 
 
 		 515 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  50.81 
 
 		 515 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  49.54 
 
 		 488 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  49.07 
 
 		 489 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  50.91 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  51.65 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  49.19 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  51.4 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  51.82 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  49.77 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  50.7 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  50.7 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  50.7 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  50.7 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  50.7 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  50.7 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  50.7 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  50.7 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  50.47 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  50.23 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  52.8 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  50.7 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  50.7 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  48.31 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  51.18 
 
 		 438 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  51.18 
 
 		 438 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  50.58 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  48.67 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  50 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  50.57 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  49.04 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  50.23 
 
 		 472 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  48.24 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  49.52 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  48.29 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  51.55 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  48.53 
 
 		 445 aa  363  4e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  49.06 
 
 		 499 aa  362  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  49.53 
 
 		 466 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  47.53 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  49.3 
 
 		 502 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  51.41 
 
 		 503 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  51.41 
 
 		 497 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  48.98 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0694  ammonium transporter  49.52 
 
 		 452 aa  356  5e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  47 
 
 		 467 aa  356  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  47.99 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  50.45 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  47.58 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  47.85 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  45.82 
 
 		 434 aa  353  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  47.85 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  49.53 
 
 		 461 aa  352  8e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  46.76 
 
 		 432 aa  352  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  47.75 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  50.35 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  47.52 
 
 		 437 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  47.75 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  47.17 
 
 		 466 aa  350  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  50 
 
 		 442 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  50.8 
 
 		 438 aa  348  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  45.87 
 
 		 410 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  48.4 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  47.37 
 
 		 449 aa  346  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  50.24 
 
 		 397 aa  345  8e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  48.16 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  44.76 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  45.39 
 
 		 410 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  47.31 
 
 		 461 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  48.05 
 
 		 431 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  50 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  47.71 
 
 		 462 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  45.52 
 
 		 410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  45.28 
 
 		 410 aa  340  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  45.15 
 
 		 410 aa  339  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  45.28 
 
 		 410 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  45.39 
 
 		 410 aa  338  9e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  46.19 
 
 		 427 aa  338  9e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  45.04 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  47.2 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  47.13 
 
 		 452 aa  336  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  44.01 
 
 		 499 aa  336  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  49.64 
 
 		 443 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  46.19 
 
 		 470 aa  335  9e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  48.2 
 
 		 408 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  50.12 
 
 		 443 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  50.12 
 
 		 443 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  45.58 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  45.77 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  44.62 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  45.06 
 
 		 476 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  49.32 
 
 		 433 aa  333  5e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>