More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0094 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0094  ammonium transporter  100 
 
 		 443 aa  877    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.162623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0089  ammonium transporter  83.97 
 
 		 443 aa  736    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1999  ammonium transporter  85.38 
 
 		 444 aa  698    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  87.39 
 
 		 444 aa  746    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0128  ammonium transporter  80.68 
 
 		 441 aa  648    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0306677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2672  ammonium transporter  88.49 
 
 		 443 aa  750    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000545054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0107  ammonium transporter  77.1 
 
 		 444 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0566  ammonium transporter  67.95 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0404362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  49.42 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  49.65 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  49.07 
 
 		 515 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  48.27 
 
 		 515 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  49.31 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  51.77 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  51.77 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  51.77 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  51.46 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  51.77 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  51.77 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  52.29 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  49.55 
 
 		 496 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  50.47 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  51.77 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  51.77 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  48.32 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  51.77 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  52.29 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  50.23 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  51.02 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  50.83 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  47.99 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  48.42 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  47.54 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  49.89 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  50.35 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  51.64 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  50.35 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  50.35 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  50.36 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  50.35 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  50.85 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  49.88 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  49.65 
 
 		 472 aa  362  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  50.48 
 
 		 466 aa  359  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  49.56 
 
 		 445 aa  359  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  47.47 
 
 		 435 aa  358  9e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  46.83 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  49.17 
 
 		 499 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  47.82 
 
 		 445 aa  353  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  51.06 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  50.69 
 
 		 442 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  51.06 
 
 		 497 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  46.97 
 
 		 410 aa  352  7e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  49.17 
 
 		 502 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  50.58 
 
 		 442 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0694  ammonium transporter  49.28 
 
 		 452 aa  351  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  47.37 
 
 		 432 aa  352  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  48.9 
 
 		 467 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  46.88 
 
 		 411 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  51.46 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  47.27 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  47.63 
 
 		 466 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  51.77 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  47.63 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  47.22 
 
 		 410 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  48.04 
 
 		 466 aa  346  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  46.14 
 
 		 437 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  46.14 
 
 		 437 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  45.91 
 
 		 437 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  47.22 
 
 		 410 aa  345  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  47.22 
 
 		 410 aa  345  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  46.97 
 
 		 410 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  47 
 
 		 449 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  48.03 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  46.14 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  46.97 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  49.65 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  47.22 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  47.2 
 
 		 410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  48.76 
 
 		 405 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  47.83 
 
 		 462 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  48.7 
 
 		 461 aa  342  9e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  50.59 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  47.52 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  50.71 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  46 
 
 		 434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  44.44 
 
 		 499 aa  340  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  46.62 
 
 		 427 aa  340  4e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  47.31 
 
 		 474 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  44.59 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  51.06 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  51.06 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  47.26 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  49.39 
 
 		 408 aa  335  7.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  46.82 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  45.2 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  49.28 
 
 		 408 aa  333  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  43.84 
 
 		 500 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  46.33 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  45.54 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>