More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0566 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0566  ammonium transporter  100 
 
 		 427 aa  843    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0404362  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0128  ammonium transporter  68.25 
 
 		 441 aa  568  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0306677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0089  ammonium transporter  68.5 
 
 		 443 aa  568  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0094  ammonium transporter  67.95 
 
 		 443 aa  548  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.162623  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2672  ammonium transporter  67.22 
 
 		 443 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000545054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  66.59 
 
 		 444 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0107  ammonium transporter  68.11 
 
 		 444 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1999  ammonium transporter  65.39 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  47.45 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  47.45 
 
 		 515 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  48.38 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  46.65 
 
 		 488 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  46.65 
 
 		 485 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.47 
 
 		 496 aa  362  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  46.74 
 
 		 507 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  49.53 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  47.16 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  48.56 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  45.88 
 
 		 463 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.24 
 
 		 449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  47.29 
 
 		 459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  44.6 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  47.53 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  46.49 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  46.32 
 
 		 472 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  45.82 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  46.59 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  46.39 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  46.59 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  45.08 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  46.06 
 
 		 466 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  46.06 
 
 		 500 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  46.06 
 
 		 466 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  46.06 
 
 		 466 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  46.06 
 
 		 500 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  46.06 
 
 		 444 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  46.06 
 
 		 478 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  45.05 
 
 		 432 aa  325  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  44.23 
 
 		 427 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  45.79 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  46.19 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  47.22 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  43.48 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  43.2 
 
 		 410 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  46.17 
 
 		 504 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  47.67 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  42.82 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  45.35 
 
 		 469 aa  322  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  46.14 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  47.57 
 
 		 397 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  46.88 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  45.93 
 
 		 500 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  45.93 
 
 		 500 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  45.93 
 
 		 500 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  48.06 
 
 		 408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  47 
 
 		 435 aa  318  9e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  45.45 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  48.06 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  44.5 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  44.5 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  44.26 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  44.73 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  47.82 
 
 		 408 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  44.29 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  43.91 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  42.48 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  45.35 
 
 		 444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  42.96 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  41.87 
 
 		 411 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  42.89 
 
 		 470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  43.4 
 
 		 451 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.66 
 
 		 462 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  45.27 
 
 		 461 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  41.84 
 
 		 432 aa  312  7.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  44.29 
 
 		 466 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  44.29 
 
 		 466 aa  312  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  43.47 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  42.48 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  42.48 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  42.23 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0694  ammonium transporter  45.08 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  42.23 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  44.83 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  42.23 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  42.76 
 
 		 501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  42.23 
 
 		 410 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  44.02 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  42.63 
 
 		 459 aa  308  8e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2309  ammonium transporter  44.52 
 
 		 437 aa  308  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  43.34 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  44.99 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  46.1 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04231  hypothetical protein  43.57 
 
 		 449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  44.73 
 
 		 464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  46.65 
 
 		 497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  46.65 
 
 		 503 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  43.71 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  44.16 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  45.75 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  44.05 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>