More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0114 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  100 
 
 
453 aa  882    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  72.54 
 
 
455 aa  603  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  64.39 
 
 
454 aa  501  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0899  ammonium transporter  55.42 
 
 
436 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  54.22 
 
 
434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  53.72 
 
 
431 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  51.35 
 
 
449 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  50.94 
 
 
461 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  52.49 
 
 
467 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  50.12 
 
 
451 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  48.42 
 
 
464 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  47.91 
 
 
457 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  49.07 
 
 
462 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  50 
 
 
405 aa  368  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  48.71 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  49.14 
 
 
438 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  49.14 
 
 
438 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  48.15 
 
 
455 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  48.68 
 
 
444 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  48.42 
 
 
410 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  47.39 
 
 
406 aa  348  8e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  47.73 
 
 
435 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  48.03 
 
 
410 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  46.72 
 
 
402 aa  347  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  48.53 
 
 
410 aa  346  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  46.72 
 
 
436 aa  345  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  48.53 
 
 
410 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  48.53 
 
 
410 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  48.28 
 
 
410 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  49.38 
 
 
405 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  47.96 
 
 
463 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  48.28 
 
 
410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  48.76 
 
 
408 aa  343  4e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  47.69 
 
 
411 aa  343  5e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  46.7 
 
 
410 aa  342  9e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  46.71 
 
 
515 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  47.46 
 
 
428 aa  342  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  48.48 
 
 
397 aa  341  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  48.51 
 
 
408 aa  341  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  47.34 
 
 
500 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  47.34 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  47.34 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  47.34 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  48.02 
 
 
408 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  46.76 
 
 
515 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  46.1 
 
 
439 aa  339  8e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  49.01 
 
 
402 aa  338  9e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  50 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  46.1 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  45.48 
 
 
466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  46.14 
 
 
501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  48.34 
 
 
470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  45.48 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  46.88 
 
 
504 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  45.71 
 
 
466 aa  336  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  45.83 
 
 
432 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2464  ammonium transporter  48.73 
 
 
456 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  46.38 
 
 
469 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  46.38 
 
 
500 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  46.38 
 
 
444 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  46.38 
 
 
478 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  46.38 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  46.38 
 
 
500 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1491  ammonium transporter  48.17 
 
 
456 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.936264  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  46.38 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  46.38 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  47.58 
 
 
470 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  47.37 
 
 
397 aa  333  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  45.25 
 
 
437 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  46.12 
 
 
402 aa  333  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  43.74 
 
 
443 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  45.02 
 
 
437 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2376  ammonium transporter  48.73 
 
 
456 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  47.78 
 
 
423 aa  332  8e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  45.02 
 
 
437 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  48.15 
 
 
461 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  44.84 
 
 
432 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  47.96 
 
 
459 aa  331  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  49.88 
 
 
397 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  45.02 
 
 
437 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  49.63 
 
 
401 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  45.64 
 
 
462 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  44.42 
 
 
411 aa  329  6e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  49.14 
 
 
411 aa  329  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  43.43 
 
 
445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  44.13 
 
 
488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  45.64 
 
 
413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  45.17 
 
 
499 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0776  ammonia permease  47.74 
 
 
398 aa  327  3e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  47.54 
 
 
474 aa  327  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  43.96 
 
 
436 aa  327  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  46.44 
 
 
429 aa  326  6e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  44.61 
 
 
434 aa  326  6e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  44.75 
 
 
446 aa  325  8.000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  44.25 
 
 
432 aa  325  8.000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  45.85 
 
 
496 aa  325  9e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  45.65 
 
 
502 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  47.39 
 
 
472 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  44.57 
 
 
441 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  47.39 
 
 
401 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>