More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2529 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  100 
 
 		 454 aa  871    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  63.85 
 
 		 455 aa  523  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  65.13 
 
 		 453 aa  519  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0899  ammonium transporter  57.91 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  56.12 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  53.9 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  49.77 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  49.45 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  50.58 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  52.71 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  49.77 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  50.61 
 
 		 462 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  50.63 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  50.37 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  48.41 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  51.49 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  53.48 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  47.92 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  48.17 
 
 		 411 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  48.41 
 
 		 410 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  48.41 
 
 		 410 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  47.92 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  48.17 
 
 		 410 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  48.17 
 
 		 410 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  53.22 
 
 		 408 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  52.27 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  48.17 
 
 		 410 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  48.58 
 
 		 515 aa  363  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  48.94 
 
 		 515 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  49.15 
 
 		 438 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  49.15 
 
 		 438 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  52.72 
 
 		 408 aa  359  7e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  46.26 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  52.48 
 
 		 408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  48.65 
 
 		 431 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  49.5 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  50.87 
 
 		 405 aa  354  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  46.85 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  46.96 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  47.38 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  52.51 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  48.25 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  49.75 
 
 		 432 aa  353  5e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  50.47 
 
 		 423 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  52.75 
 
 		 402 aa  352  7e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  46.92 
 
 		 488 aa  352  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  50.38 
 
 		 397 aa  351  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  53.13 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  47.45 
 
 		 431 aa  349  6e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  48.8 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  46.57 
 
 		 489 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  46.4 
 
 		 411 aa  346  5e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  47.42 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  45.9 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  47.13 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  47.7 
 
 		 433 aa  342  8e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  45.73 
 
 		 485 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  46.77 
 
 		 434 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  46.65 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  48.95 
 
 		 461 aa  341  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  46.91 
 
 		 413 aa  340  4e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  47.58 
 
 		 470 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  46.96 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  47.85 
 
 		 459 aa  338  8e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  46.72 
 
 		 466 aa  338  9e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  47.72 
 
 		 446 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  45.89 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  45.74 
 
 		 466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  46 
 
 		 507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  45.6 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  45.83 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  45.74 
 
 		 466 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  44.9 
 
 		 443 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  45.6 
 
 		 437 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  47.09 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  46.36 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  47.09 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  47.09 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  46.6 
 
 		 500 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  46.6 
 
 		 500 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  46.6 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  46.84 
 
 		 504 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  46.6 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  46.6 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.48 
 
 		 496 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  44.79 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  45.6 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  46.12 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  46.12 
 
 		 478 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04231  hypothetical protein  45.95 
 
 		 449 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  46.36 
 
 		 499 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2464  ammonium transporter  53.49 
 
 		 456 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  46.05 
 
 		 453 aa  332  8e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  45.87 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1491  ammonium transporter  53.25 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.936264  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2376  ammonium transporter  53.51 
 
 		 456 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  48.08 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  44.84 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  44.84 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  44.84 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>