More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1147 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  100 
 
 		 401 aa  790    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  68.08 
 
 		 402 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  65.67 
 
 		 402 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  59.9 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  63.93 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  60.64 
 
 		 405 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  55.64 
 
 		 457 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  57 
 
 		 434 aa  428  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  53.09 
 
 		 411 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  55.06 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  53.09 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  53.69 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  57.29 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  52.84 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  53.09 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  52.84 
 
 		 410 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  53.09 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  52.84 
 
 		 410 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  52.59 
 
 		 410 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  52.59 
 
 		 410 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  55.58 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  55.61 
 
 		 467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  52.24 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  52.13 
 
 		 488 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  49 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  52.23 
 
 		 408 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  52.13 
 
 		 515 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  52.13 
 
 		 515 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  52.23 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  50.59 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  50.82 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  51.28 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  50.25 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  48.15 
 
 		 406 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  51.24 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  49.52 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  50.24 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  48.28 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  49.63 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  47.37 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  47.29 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  51.49 
 
 		 423 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  45.98 
 
 		 398 aa  355  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  49.14 
 
 		 438 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  47.74 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  49.14 
 
 		 438 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  50.49 
 
 		 474 aa  352  5e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  47.54 
 
 		 431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  47.24 
 
 		 400 aa  352  8e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  47.03 
 
 		 444 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  48.09 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  45.32 
 
 		 435 aa  349  4e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  47.39 
 
 		 453 aa  350  4e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  49.63 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  43.92 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  47.65 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  47.93 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  47.33 
 
 		 469 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  47.09 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  47.89 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  47.09 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  47.09 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  47.09 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  47.09 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  47.09 
 
 		 444 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  47.09 
 
 		 478 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  45.61 
 
 		 445 aa  342  8e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  45.97 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  46.08 
 
 		 437 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  46.93 
 
 		 429 aa  339  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  45.74 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  46.84 
 
 		 500 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  45.5 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  46.84 
 
 		 500 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  46.84 
 
 		 500 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  46.55 
 
 		 432 aa  338  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  45.5 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  47.36 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  47.09 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  46.6 
 
 		 500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  47.17 
 
 		 427 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  49.13 
 
 		 454 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  49.01 
 
 		 411 aa  333  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  47.56 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  45.39 
 
 		 501 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  47.03 
 
 		 431 aa  330  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  43.9 
 
 		 466 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  46.19 
 
 		 467 aa  329  6e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  43.9 
 
 		 466 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  46 
 
 		 443 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  44.91 
 
 		 461 aa  328  8e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  45.72 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  44.2 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  46 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  45.75 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  45.12 
 
 		 499 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  47.89 
 
 		 433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  45.81 
 
 		 413 aa  326  6e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  45.3 
 
 		 411 aa  324  1e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  46.53 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>