More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0221 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  100 
 
 		 446 aa  870    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  73.66 
 
 		 439 aa  631  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  56.01 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  59.57 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  52.82 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  53.4 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  55.81 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  53.56 
 
 		 478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  56.49 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  57.07 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  54.57 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  57.55 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  49.12 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  52.82 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  52.14 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  50.93 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  58.12 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  50.96 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  53.24 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  56.64 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  52.04 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  49.32 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  47.3 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  48.93 
 
 		 427 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  50.48 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  53.08 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  49 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  50.83 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  50.6 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  48.85 
 
 		 450 aa  362  6e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  48.62 
 
 		 446 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  48.62 
 
 		 446 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  48.62 
 
 		 446 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  50.12 
 
 		 443 aa  362  9e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  53.64 
 
 		 451 aa  361  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  48.69 
 
 		 457 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  50.6 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  51.94 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  48.82 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  52.06 
 
 		 442 aa  354  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  49.53 
 
 		 467 aa  352  8e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  46.75 
 
 		 405 aa  348  9e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  49.08 
 
 		 450 aa  348  9e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  47.48 
 
 		 405 aa  346  6e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  47.34 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  49.76 
 
 		 500 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  49.76 
 
 		 466 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  49.76 
 
 		 500 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  49.76 
 
 		 466 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  49.76 
 
 		 466 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  46.83 
 
 		 461 aa  343  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  49.76 
 
 		 444 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  49.76 
 
 		 478 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  47.67 
 
 		 488 aa  343  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  50 
 
 		 469 aa  343  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  48.93 
 
 		 451 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  48.8 
 
 		 504 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  48.8 
 
 		 499 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  48.8 
 
 		 500 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  46.89 
 
 		 501 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  48.33 
 
 		 500 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  48.33 
 
 		 500 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  49.88 
 
 		 417 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  47.91 
 
 		 485 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  48.33 
 
 		 500 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  49.88 
 
 		 417 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  50.36 
 
 		 417 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  49.88 
 
 		 417 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  46.67 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  46.37 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  48.21 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  47.1 
 
 		 431 aa  333  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  48.09 
 
 		 502 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  46.44 
 
 		 515 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  46.44 
 
 		 489 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  45.56 
 
 		 453 aa  331  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  47.72 
 
 		 454 aa  330  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  47.49 
 
 		 429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  47.78 
 
 		 431 aa  329  7e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  46.89 
 
 		 438 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  46.89 
 
 		 438 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  45.05 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  48.8 
 
 		 408 aa  326  5e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  45.8 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  47.6 
 
 		 397 aa  326  5e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  47.09 
 
 		 424 aa  326  6e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  48.32 
 
 		 408 aa  325  9e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  44.9 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  48.56 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  46.25 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  45.35 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  47.13 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  45.08 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  44.9 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  43.17 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  46.9 
 
 		 507 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  45.82 
 
 		 431 aa  323  5e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  43.94 
 
 		 410 aa  322  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  43.94 
 
 		 410 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  50.35 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>