More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0659 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  100 
 
 		 439 aa  865    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  73.66 
 
 		 446 aa  617  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  53.15 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  53.61 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  59.56 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  55.88 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  55.97 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  53.18 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  51.25 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  52.28 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  55.88 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  55.19 
 
 		 445 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  55.43 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  48.57 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  52.13 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  53.15 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  49.66 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  48.11 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  49.76 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  49.77 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  50.48 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  47.48 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  49.89 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  52.29 
 
 		 434 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  49.16 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  53.17 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  51.68 
 
 		 447 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  51.21 
 
 		 457 aa  363  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  45.41 
 
 		 465 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  52.2 
 
 		 450 aa  360  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  49.65 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  48.17 
 
 		 467 aa  352  7e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  50 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  48.4 
 
 		 450 aa  349  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  47.03 
 
 		 446 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  47.03 
 
 		 446 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  47.03 
 
 		 446 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  47.46 
 
 		 405 aa  345  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  48.45 
 
 		 451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  49.23 
 
 		 477 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  45.11 
 
 		 410 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  48.02 
 
 		 431 aa  339  5e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  46.1 
 
 		 453 aa  338  8e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  48.09 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  45.35 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  48.93 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  45.11 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  46.56 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  46.87 
 
 		 515 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  47.06 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  45.11 
 
 		 410 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  45.11 
 
 		 410 aa  335  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  47.56 
 
 		 488 aa  335  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  44.87 
 
 		 410 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  50.12 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  46.64 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  44.87 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  48.09 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  47.38 
 
 		 454 aa  333  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  44.87 
 
 		 410 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  48.3 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  47.96 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  44.87 
 
 		 410 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  47.05 
 
 		 455 aa  332  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  48.8 
 
 		 408 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  47.82 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.56 
 
 		 496 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  46.3 
 
 		 489 aa  329  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  48.8 
 
 		 408 aa  328  9e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  46.92 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.22 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  46.92 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  46.92 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  46.92 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  46.92 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  46.92 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  46.92 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  45.62 
 
 		 450 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  48.56 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  47.78 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  46.47 
 
 		 507 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  46.51 
 
 		 433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  42.62 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  47.31 
 
 		 470 aa  326  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  47.6 
 
 		 431 aa  326  6e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  48.31 
 
 		 433 aa  326  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  46.57 
 
 		 504 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  47.96 
 
 		 438 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  47.96 
 
 		 438 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  46.57 
 
 		 469 aa  325  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  46.59 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  46.59 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  46.59 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  46.92 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  45.65 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  46.81 
 
 		 500 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  47.1 
 
 		 485 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  46.23 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  44.47 
 
 		 406 aa  323  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  49.4 
 
 		 401 aa  322  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>