More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3518 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  100 
 
 		 429 aa  838    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  63.59 
 
 		 440 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  59.67 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  57.69 
 
 		 417 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  56.07 
 
 		 456 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  57.69 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  55.92 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  55.69 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  55.69 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  53.18 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  52.51 
 
 		 478 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  54.94 
 
 		 477 aa  388  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  51.68 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  54.86 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  50.35 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  48.7 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  53.56 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  48.82 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  49.66 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  46.56 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  50.84 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  51.04 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  49.16 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  46.87 
 
 		 441 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  48.46 
 
 		 434 aa  359  5e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  46.41 
 
 		 446 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  46.41 
 
 		 446 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  46.41 
 
 		 446 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  48.17 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  46.39 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  51.49 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  46.82 
 
 		 424 aa  350  4e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  46.24 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  51.08 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  45.06 
 
 		 438 aa  346  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.26 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  46.8 
 
 		 402 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  44.34 
 
 		 442 aa  342  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  48.82 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  47.15 
 
 		 450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  45.7 
 
 		 450 aa  333  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4808  ammonium transporter  45.87 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  43.78 
 
 		 489 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  45.24 
 
 		 467 aa  319  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  45.95 
 
 		 434 aa  319  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  45.56 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  45.82 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  42.82 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  42.86 
 
 		 488 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  47.76 
 
 		 441 aa  312  7.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  45.82 
 
 		 408 aa  310  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  42.65 
 
 		 410 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  43.78 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  44.84 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  42.93 
 
 		 405 aa  309  5e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  42.56 
 
 		 496 aa  308  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  44.1 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  44.9 
 
 		 451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  42.42 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2057  ammonium transporter  45.21 
 
 		 404 aa  307  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00112408  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  44.34 
 
 		 402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  46.72 
 
 		 464 aa  305  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  42.42 
 
 		 410 aa  305  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  42.33 
 
 		 507 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  41.78 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  42.42 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  42.18 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  42.72 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  43.07 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  44.5 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  42.18 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  42.18 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  44.37 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  43.68 
 
 		 450 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  43.53 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  42.45 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  43.94 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  44.26 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  41.94 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  42.08 
 
 		 431 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  44.26 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  41.94 
 
 		 410 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  44.03 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  41.71 
 
 		 515 aa  299  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  43.03 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  42.12 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  43.23 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  42.12 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  42.07 
 
 		 462 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  43.26 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  42.12 
 
 		 466 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  42.62 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  43.16 
 
 		 476 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  45.07 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  43.07 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  44.05 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  43.12 
 
 		 436 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  43.78 
 
 		 444 aa  292  7e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  44.14 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  43.58 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>