More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0968 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  100 
 
 		 439 aa  858    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  73.74 
 
 		 439 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  67.48 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  60.77 
 
 		 456 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  60.77 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  55.89 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  57.62 
 
 		 474 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  54.55 
 
 		 439 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  57.69 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  52.01 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  54.78 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  56.19 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  55.53 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  51.21 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  54.73 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  54.2 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  53.41 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  53.41 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  53.41 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  53.18 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  53.24 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  56 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  52.51 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  51.85 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  52.68 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  53.14 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  54.63 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  54.09 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  51.95 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  49.88 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  51.09 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  52.13 
 
 		 440 aa  385  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  51.09 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  49.44 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  54.14 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  55.32 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  47.25 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  52.12 
 
 		 457 aa  363  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  50.62 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  49.2 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  49.76 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  49.64 
 
 		 467 aa  359  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  48.29 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  48.31 
 
 		 434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  49.06 
 
 		 417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  49.88 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  49.76 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  51.76 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  50.24 
 
 		 428 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  49.52 
 
 		 429 aa  352  8.999999999999999e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  48.79 
 
 		 461 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  47.57 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  49.39 
 
 		 433 aa  349  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  47.8 
 
 		 462 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  49.39 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  48.92 
 
 		 501 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  51.54 
 
 		 417 aa  346  6e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  49.76 
 
 		 444 aa  345  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  46.57 
 
 		 398 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  50 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  48.38 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  45.7 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  51.42 
 
 		 417 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  51.42 
 
 		 417 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  48.38 
 
 		 476 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  49.51 
 
 		 431 aa  342  9e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  51.42 
 
 		 417 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  51.03 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  48.68 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  48.82 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  48.68 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  48.68 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  50.36 
 
 		 499 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  50.49 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  48.68 
 
 		 500 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  48.68 
 
 		 500 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  50.49 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  48.68 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  48.68 
 
 		 478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  48.92 
 
 		 504 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  51.08 
 
 		 502 aa  339  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  48.44 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  45.99 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  45.92 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  48.8 
 
 		 500 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  47.79 
 
 		 431 aa  336  5.999999999999999e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  45.67 
 
 		 489 aa  335  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  45.95 
 
 		 402 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  50.24 
 
 		 423 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  48.56 
 
 		 500 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  48.56 
 
 		 500 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  48.56 
 
 		 500 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  48.28 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  46.26 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  50 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  48.08 
 
 		 464 aa  334  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  48.53 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  46.26 
 
 		 515 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.3 
 
 		 496 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  46.3 
 
 		 507 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>