More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3269 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  100 
 
 		 441 aa  868    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  58.04 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  57.73 
 
 		 459 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  56.24 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  56.39 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  53.32 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  54.93 
 
 		 474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  53.53 
 
 		 424 aa  401  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  52.67 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  52.67 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  52.67 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  51.76 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  50.78 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  52.31 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  52.2 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  48.77 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  52.75 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  54.74 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  50.48 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  50.97 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  50.36 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  51.07 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  49.45 
 
 		 450 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  47.93 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  51.07 
 
 		 440 aa  361  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  49.76 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  52.07 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  54.07 
 
 		 439 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  52.64 
 
 		 445 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  50.12 
 
 		 429 aa  350  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  49.65 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  51.8 
 
 		 477 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  45.99 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  47.29 
 
 		 446 aa  336  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  48.34 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  54.44 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  47.71 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  51.42 
 
 		 439 aa  328  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  46.38 
 
 		 417 aa  326  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  48.55 
 
 		 449 aa  326  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  47.36 
 
 		 461 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  44.82 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  45.18 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  44.98 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  45.17 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  44.98 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  44.34 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  44.98 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  44.98 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  47.23 
 
 		 428 aa  322  7e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  44.58 
 
 		 428 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  44.58 
 
 		 428 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  44.69 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  44.58 
 
 		 428 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  44.58 
 
 		 428 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  44.58 
 
 		 428 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  44.34 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  44.34 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  44.34 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  46.12 
 
 		 480 aa  319  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  44.93 
 
 		 430 aa  318  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  47.51 
 
 		 504 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  44.93 
 
 		 430 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  44.93 
 
 		 430 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  44.66 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  47.76 
 
 		 429 aa  316  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  47.03 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  47.03 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  47.03 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  46.17 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  46.72 
 
 		 431 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  43.98 
 
 		 452 aa  312  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  46.56 
 
 		 500 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  44.87 
 
 		 513 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  45.97 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  45.95 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  47.26 
 
 		 433 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  44.22 
 
 		 436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  45.28 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  46.21 
 
 		 501 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  45.5 
 
 		 466 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  45.5 
 
 		 444 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  46.21 
 
 		 434 aa  309  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  45.5 
 
 		 478 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  45.5 
 
 		 466 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  45.5 
 
 		 500 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  45.5 
 
 		 466 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  45.5 
 
 		 500 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  43.96 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  49.78 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  43.17 
 
 		 504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  44.89 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  44.71 
 
 		 515 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  48.32 
 
 		 438 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  48.32 
 
 		 438 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  42.41 
 
 		 494 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  45.94 
 
 		 463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  51.42 
 
 		 420 aa  305  8.000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  43.48 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  46.21 
 
 		 462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>