More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2492 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  88.91 
 
 		 451 aa  749    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  100 
 
 		 450 aa  878    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  66.52 
 
 		 457 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  70.41 
 
 		 443 aa  551  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  57.52 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  59.06 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  59.29 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  59.1 
 
 		 438 aa  448  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  60.58 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  64.62 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  57.94 
 
 		 442 aa  441  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  58.17 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  56.58 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  56.41 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  56.58 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  56.58 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  56.82 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  56.26 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  54.13 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  52.86 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  55.74 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  53.73 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  52.94 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  52.2 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  53.36 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  47.99 
 
 		 466 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  49.78 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  49.54 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  53.13 
 
 		 477 aa  362  6e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  54.81 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  52.86 
 
 		 441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  51.94 
 
 		 446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  52.96 
 
 		 439 aa  354  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  51.57 
 
 		 478 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  51.08 
 
 		 456 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  48.06 
 
 		 427 aa  349  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  48.67 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  53.49 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  49.16 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  49.25 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  48.34 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  50.62 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  50.62 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  49.5 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  50.62 
 
 		 417 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  46.34 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  44.36 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  42.99 
 
 		 515 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  43.45 
 
 		 488 aa  292  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  45.06 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  44.87 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  44.84 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  45.99 
 
 		 429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  42.49 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  45.37 
 
 		 431 aa  288  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  42.79 
 
 		 410 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  44.04 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  46.04 
 
 		 454 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  45.26 
 
 		 428 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  43.32 
 
 		 485 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  44.9 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  43.87 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  42.55 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  45.01 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  45.01 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  44.79 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  45.01 
 
 		 428 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  45.01 
 
 		 428 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  45.01 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  43.83 
 
 		 430 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  43.2 
 
 		 434 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  43.03 
 
 		 410 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  43.72 
 
 		 461 aa  282  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  44.77 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  44.77 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  44.77 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  42.4 
 
 		 489 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  43.58 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  44.77 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  44.77 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  44.84 
 
 		 455 aa  282  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  44.77 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  44.77 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  42.96 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  42.96 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  42.72 
 
 		 410 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  42.82 
 
 		 410 aa  279  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  42.72 
 
 		 410 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  43.55 
 
 		 494 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  42.72 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  42.47 
 
 		 496 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  45.82 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  44.31 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  46.17 
 
 		 444 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  45.15 
 
 		 428 aa  276  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  44.58 
 
 		 451 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  43.58 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  43.58 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  43.16 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  43.58 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>