More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1465 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  80.69 
 
 		 441 aa  706    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  77.14 
 
 		 438 aa  649    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  100 
 
 		 435 aa  840    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  70.48 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  70.28 
 
 		 424 aa  566  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  65.13 
 
 		 446 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  65.13 
 
 		 446 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  65.13 
 
 		 446 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  64.64 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  65.5 
 
 		 450 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  64.92 
 
 		 450 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  65.73 
 
 		 450 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  60.32 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  61.01 
 
 		 431 aa  468  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  57.11 
 
 		 474 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  59.29 
 
 		 450 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  58.12 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  56.8 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  58.96 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  53.15 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  57.21 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  59.45 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  55.73 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  51.63 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  52.8 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  50.23 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  50.22 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  50 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  55.1 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  50.24 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  54.4 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  53.32 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  52.33 
 
 		 439 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  52.5 
 
 		 439 aa  360  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  46.92 
 
 		 465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  49.18 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  56.48 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  47.74 
 
 		 427 aa  352  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  50 
 
 		 417 aa  352  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  48.84 
 
 		 424 aa  347  4e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  48.12 
 
 		 449 aa  345  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  49.15 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  44.92 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  50.47 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  47.09 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  50.7 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  47.66 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  50.35 
 
 		 417 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  50.35 
 
 		 417 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  50.35 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  46.39 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  44.62 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  44.39 
 
 		 488 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  45.48 
 
 		 467 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  45.02 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  45.18 
 
 		 515 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  44.72 
 
 		 515 aa  319  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  44.16 
 
 		 489 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  45.01 
 
 		 461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  43.99 
 
 		 496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  46.56 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  45.48 
 
 		 476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  45.58 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  45.09 
 
 		 428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  46.12 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  44.34 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  45.31 
 
 		 464 aa  306  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  43.95 
 
 		 449 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  43.18 
 
 		 507 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  45.05 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  44.29 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  44.66 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  45.18 
 
 		 431 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  42.56 
 
 		 453 aa  302  6.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  45.37 
 
 		 499 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  42.42 
 
 		 397 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  44.99 
 
 		 454 aa  302  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  43.12 
 
 		 410 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  45.58 
 
 		 515 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  42.12 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  45.22 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  45.58 
 
 		 524 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  44.32 
 
 		 510 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  44.79 
 
 		 502 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  43.16 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  42.86 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  43.59 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  44.1 
 
 		 433 aa  300  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  45.83 
 
 		 455 aa  300  5e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  46.1 
 
 		 423 aa  300  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  43.16 
 
 		 452 aa  299  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  43.56 
 
 		 402 aa  299  8e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  44.03 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  42.89 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  42.89 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  44.03 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  46.37 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  43.64 
 
 		 513 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  44.27 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  46.14 
 
 		 480 aa  297  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>