More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1936 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  86.22 
 
 		 450 aa  721    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  100 
 
 		 446 aa  872    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  100 
 
 		 446 aa  872    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  100 
 
 		 446 aa  872    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  85.11 
 
 		 450 aa  733    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  73.05 
 
 		 450 aa  611  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  68.97 
 
 		 442 aa  603  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  66.97 
 
 		 438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  64.61 
 
 		 441 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  65.13 
 
 		 435 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  62.95 
 
 		 434 aa  504  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  63.13 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  57.24 
 
 		 474 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  57.42 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  54.9 
 
 		 456 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  56.58 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  56.35 
 
 		 451 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  55.38 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  56.62 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  52.44 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  54.22 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  51.61 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  52.98 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  51.12 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  49.78 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  49.89 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  49.89 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  49.66 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  48.99 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  52.05 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  52.67 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  52.04 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  52.05 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  47.03 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  46.49 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  48.62 
 
 		 446 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  48.07 
 
 		 429 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  47.62 
 
 		 417 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  50.46 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  54.38 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  46.93 
 
 		 467 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  49.66 
 
 		 438 aa  339  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  44.7 
 
 		 429 aa  334  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  46.41 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  44.84 
 
 		 431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  45.05 
 
 		 428 aa  329  6e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  46.02 
 
 		 451 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  45.8 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  45.43 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  44.42 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  47.39 
 
 		 417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  43.89 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  43.74 
 
 		 405 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  47.27 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  47.27 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  47.27 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  43.76 
 
 		 457 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  43.85 
 
 		 485 aa  316  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  42.67 
 
 		 438 aa  315  8e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  44.71 
 
 		 496 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  44.09 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.47 
 
 		 462 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  43.62 
 
 		 488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  44.34 
 
 		 431 aa  313  5.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  43.96 
 
 		 453 aa  312  6.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  43.12 
 
 		 434 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  45.41 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  43.9 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  43.85 
 
 		 515 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  43.42 
 
 		 507 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  43.4 
 
 		 515 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  42.26 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  42.73 
 
 		 489 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  40.81 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  43.09 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  45.49 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  42.27 
 
 		 411 aa  300  5e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  42.45 
 
 		 461 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  43.84 
 
 		 402 aa  299  8e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  44.62 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  45.19 
 
 		 423 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  42.86 
 
 		 410 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  42.51 
 
 		 438 aa  296  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  40.13 
 
 		 500 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  45.25 
 
 		 443 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  42.51 
 
 		 438 aa  296  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  46.15 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  43.57 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  46.15 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0111  ammonium transporter  44.9 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0168687 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  42.15 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  42.66 
 
 		 411 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  42.32 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  42.4 
 
 		 410 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  45.57 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  42.86 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  46.22 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  42.86 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  42.32 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  40.51 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>