More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2178 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  92.22 
 
 		 450 aa  785    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  85.11 
 
 		 446 aa  734    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  85.11 
 
 		 446 aa  734    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  85.11 
 
 		 446 aa  734    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  100 
 
 		 450 aa  877    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  68.96 
 
 		 442 aa  589  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  70.55 
 
 		 450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  66.2 
 
 		 438 aa  545  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  63.45 
 
 		 441 aa  533  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  65.5 
 
 		 435 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  61.99 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  61.96 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  56.56 
 
 		 474 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  54.42 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  55.88 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  56.82 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  53.14 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  54.16 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  53.69 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  54.04 
 
 		 443 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  53.88 
 
 		 445 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  52.75 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  51.63 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  49.67 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  50.57 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  49 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  52.27 
 
 		 439 aa  372  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  48.78 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  51.76 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  51.58 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  49.09 
 
 		 432 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  48.4 
 
 		 439 aa  359  5e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  48.85 
 
 		 446 aa  356  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  51.14 
 
 		 433 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  47.63 
 
 		 427 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  48.44 
 
 		 429 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  46.71 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  48.98 
 
 		 417 aa  346  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  46.62 
 
 		 429 aa  346  6e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  55.48 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  49.66 
 
 		 442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  45.8 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  46.74 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  45.5 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  45.39 
 
 		 431 aa  329  7e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  44.89 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  50 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  49.66 
 
 		 417 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  44.72 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  46.24 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  46.92 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  43.08 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  45.02 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  43.75 
 
 		 449 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  44.92 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  47.62 
 
 		 417 aa  312  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  47.62 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  47.62 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  43.67 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  44.04 
 
 		 413 aa  311  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  43.74 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  42.7 
 
 		 464 aa  310  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  42.37 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  46.14 
 
 		 445 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  42.89 
 
 		 488 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  42.02 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  43.12 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  42.99 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  40.22 
 
 		 433 aa  303  6.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  42.53 
 
 		 410 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  44.78 
 
 		 444 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  43.91 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  43.3 
 
 		 496 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  43.72 
 
 		 515 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  42.07 
 
 		 397 aa  300  5e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  43.27 
 
 		 515 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  42.31 
 
 		 411 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  45.02 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  43.81 
 
 		 402 aa  297  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  42.53 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  42.53 
 
 		 410 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  41.89 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  43.38 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  42.08 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  41.86 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  43.08 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  45.1 
 
 		 443 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  42.86 
 
 		 489 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  42.31 
 
 		 410 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  42.31 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  44.39 
 
 		 452 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  43.28 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  43.71 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  43.26 
 
 		 504 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  46.21 
 
 		 445 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  45.74 
 
 		 443 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  42.47 
 
 		 449 aa  292  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  45.74 
 
 		 443 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  45.95 
 
 		 445 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  42.6 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>