More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5259 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  89.69 
 
 		 417 aa  719    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  100 
 
 		 417 aa  817    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  99.76 
 
 		 417 aa  815    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  99.76 
 
 		 417 aa  815    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  89.45 
 
 		 417 aa  699    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  63.61 
 
 		 440 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  60.14 
 
 		 456 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  60.38 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  55.92 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  60.58 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  54.66 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  51.73 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  53.44 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  49.77 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  53.92 
 
 		 478 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  50.46 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  50.12 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  49.77 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  53 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  50.35 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  49.88 
 
 		 432 aa  363  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  48.47 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  49.88 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  49.76 
 
 		 429 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  48.56 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  48.33 
 
 		 434 aa  349  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  48.37 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  50.24 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  47.27 
 
 		 446 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  47.27 
 
 		 446 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  47.27 
 
 		 446 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  53.85 
 
 		 438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  48.28 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  47.62 
 
 		 450 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  50.71 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.6 
 
 		 449 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  51.54 
 
 		 439 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  50.13 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  47.2 
 
 		 450 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  46.04 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  44.74 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  44.26 
 
 		 411 aa  319  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  47.74 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  43.54 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  43.78 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  43.78 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  43.78 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  51.44 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  43.78 
 
 		 410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  45.8 
 
 		 467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  43.54 
 
 		 410 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  43.54 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  49.38 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  43.17 
 
 		 410 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  44.69 
 
 		 401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  43.45 
 
 		 489 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  44.24 
 
 		 515 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  44.6 
 
 		 434 aa  303  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  44.01 
 
 		 515 aa  302  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  45.65 
 
 		 443 aa  299  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4808  ammonium transporter  43.03 
 
 		 456 aa  299  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  45.13 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  46.83 
 
 		 464 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  44.36 
 
 		 451 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2251  ammonium transporter  46.34 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  47.13 
 
 		 457 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  46.38 
 
 		 402 aa  297  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  43.69 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  43.55 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  43.55 
 
 		 488 aa  296  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  44.52 
 
 		 461 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  45.76 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  47.9 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  42.72 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  46.14 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  41.3 
 
 		 457 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  42.24 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  46.5 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2057  ammonium transporter  44.07 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00112408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  44.06 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  42.75 
 
 		 431 aa  286  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  43.84 
 
 		 507 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  41.59 
 
 		 402 aa  285  7e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  43.27 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  43.27 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  41.75 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  42.04 
 
 		 434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  40.53 
 
 		 399 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  43.51 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  43.58 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  42.33 
 
 		 476 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  42.02 
 
 		 449 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  42.02 
 
 		 441 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  42.65 
 
 		 469 aa  279  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  43.17 
 
 		 466 aa  279  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  43.51 
 
 		 408 aa  278  9e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  39.81 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  44.1 
 
 		 454 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  42.28 
 
 		 466 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  42.28 
 
 		 500 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>