More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2710 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  100 
 
 		 402 aa  787    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2057  ammonium transporter  64.36 
 
 		 404 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00112408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  47.54 
 
 		 465 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.06 
 
 		 449 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  48.26 
 
 		 432 aa  345  7e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  46.83 
 
 		 474 aa  338  8e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  48.91 
 
 		 434 aa  338  9e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  47.28 
 
 		 456 aa  335  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  47.27 
 
 		 466 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  46.23 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  46.5 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  46.57 
 
 		 451 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  49.5 
 
 		 408 aa  323  3e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  49.38 
 
 		 408 aa  323  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  49 
 
 		 408 aa  322  6e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  46.25 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  47.41 
 
 		 478 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  46.8 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  45.93 
 
 		 488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  45.86 
 
 		 398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  44.25 
 
 		 439 aa  319  6e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  46.67 
 
 		 456 aa  319  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  45.08 
 
 		 489 aa  318  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  46.45 
 
 		 447 aa  318  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  45 
 
 		 411 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  44.72 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  45.23 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  48.12 
 
 		 428 aa  316  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  44.5 
 
 		 410 aa  316  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  44.75 
 
 		 410 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  44.75 
 
 		 410 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  44.75 
 
 		 410 aa  315  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  44.75 
 
 		 410 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  44.75 
 
 		 410 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  44.5 
 
 		 410 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  47.78 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  44.25 
 
 		 410 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  43.83 
 
 		 402 aa  310  4e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  43.03 
 
 		 441 aa  309  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  43.97 
 
 		 459 aa  309  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  46.57 
 
 		 440 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  44.74 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  45.22 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  44.74 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  44.63 
 
 		 500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  44.63 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  44.63 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  44.63 
 
 		 500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  49.12 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  44.63 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  44.52 
 
 		 515 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  49.37 
 
 		 477 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  44.29 
 
 		 515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  44.25 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  50 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  46.68 
 
 		 439 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  42.04 
 
 		 496 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  45.76 
 
 		 434 aa  302  7.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  42.55 
 
 		 507 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  43.86 
 
 		 399 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  45.74 
 
 		 429 aa  300  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  44.12 
 
 		 500 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  44.12 
 
 		 500 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  44.47 
 
 		 500 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  44.12 
 
 		 500 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  43.98 
 
 		 504 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  43.28 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  41.96 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  42.29 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  42.07 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  44.23 
 
 		 444 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  43.52 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  44.58 
 
 		 431 aa  295  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  44.08 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  40.6 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  42.53 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  42.08 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  45.69 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  43.03 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  45.41 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  45.25 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  42.93 
 
 		 499 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  45.84 
 
 		 411 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  43.48 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  45.54 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  45.54 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  44.02 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  49.12 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  43.56 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  44.17 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  43.29 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  42.68 
 
 		 502 aa  289  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  43.03 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  43.39 
 
 		 462 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  43.8 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  43.91 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  42.59 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  43.41 
 
 		 463 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  46.23 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  44.03 
 
 		 461 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>