More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1608 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  100 
 
 		 442 aa  865    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  68.46 
 
 		 446 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  68.46 
 
 		 446 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  68.46 
 
 		 446 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  70.6 
 
 		 450 aa  595  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  68.96 
 
 		 450 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  70.29 
 
 		 450 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  64.64 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  63.47 
 
 		 441 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  62.94 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  60.23 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  56.53 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  58.58 
 
 		 474 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  54.19 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  58.18 
 
 		 451 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  57.94 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  54.23 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  54.86 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  54.73 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  56.15 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  50.57 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  50.57 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  53.66 
 
 		 477 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  50.8 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  50.23 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  52.41 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  50.81 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  52.71 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  49.89 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  52.63 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  52.05 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  47.76 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  50.78 
 
 		 441 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  46.52 
 
 		 465 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  47.02 
 
 		 429 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  45.66 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  50.8 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  48.17 
 
 		 417 aa  343  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  49.77 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  53.23 
 
 		 420 aa  335  9e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  45.8 
 
 		 442 aa  329  7e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  47.03 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  46.3 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  45.12 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  46.12 
 
 		 451 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  44.34 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  46.77 
 
 		 480 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  43.84 
 
 		 413 aa  317  3e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  47.95 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  43.96 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  44.85 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  48.28 
 
 		 417 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  48.28 
 
 		 417 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  45.1 
 
 		 488 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  42.95 
 
 		 453 aa  312  7.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  48.28 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  42.24 
 
 		 411 aa  310  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  44.22 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  44.35 
 
 		 507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  43.65 
 
 		 405 aa  310  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  44.75 
 
 		 428 aa  309  5e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  44.37 
 
 		 496 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  45.02 
 
 		 485 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  44.75 
 
 		 428 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  44.52 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  44.52 
 
 		 428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  43.5 
 
 		 494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  44.52 
 
 		 428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  44.52 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  44.52 
 
 		 428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  44.52 
 
 		 428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  44.52 
 
 		 428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  43.02 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  44.8 
 
 		 515 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  43.02 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  45.39 
 
 		 461 aa  307  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  43.25 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  43.02 
 
 		 428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  43.02 
 
 		 428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  44.67 
 
 		 515 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  45.24 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  44.12 
 
 		 515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  44.55 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  44.42 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  42.21 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  43.69 
 
 		 489 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  44.04 
 
 		 428 aa  302  8.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  43.43 
 
 		 515 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0111  ammonium transporter  45.77 
 
 		 476 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0168687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  43.65 
 
 		 524 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  43.68 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  43.86 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  42.92 
 
 		 504 aa  299  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  41.67 
 
 		 405 aa  300  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  42.63 
 
 		 449 aa  299  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  43.54 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  42.76 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0164  ammonium transporter  47.15 
 
 		 475 aa  296  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.611454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  43.28 
 
 		 410 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  45.64 
 
 		 454 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>