More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1236 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  100 
 
 		 431 aa  846    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  60.09 
 
 		 441 aa  500  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  61.01 
 
 		 435 aa  495  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  60.55 
 
 		 438 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  59.9 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  62.14 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  55.38 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  55.38 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  55.38 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  54.86 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  53.1 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  53.69 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  54.84 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  50.71 
 
 		 474 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  52.7 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  53.49 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  52.05 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  48.02 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  47.91 
 
 		 466 aa  359  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  49.41 
 
 		 478 aa  359  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  51.41 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  49.56 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  49.43 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  49.77 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  48.71 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  49.88 
 
 		 447 aa  355  8.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  46.19 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  46.93 
 
 		 465 aa  349  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  46.98 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  47.99 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  50.47 
 
 		 439 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  48.02 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  46.62 
 
 		 439 aa  329  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  49.77 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  47.78 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  47.24 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  47.71 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  46.73 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  46.45 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  44.99 
 
 		 515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  44.76 
 
 		 515 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  45.08 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  43.94 
 
 		 457 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  46.46 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  44.99 
 
 		 488 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  50.71 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  47.4 
 
 		 436 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  44.89 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  43.36 
 
 		 485 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  44.81 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  46.85 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  45.71 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  45.75 
 
 		 507 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  46.28 
 
 		 442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  46.26 
 
 		 417 aa  308  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  45.29 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  45.56 
 
 		 504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  43.74 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  45.32 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  45.32 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  45.32 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  44.34 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  45.11 
 
 		 513 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  45.56 
 
 		 510 aa  305  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  46.03 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  45.32 
 
 		 500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  44.12 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  44.44 
 
 		 428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  46.45 
 
 		 480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  44.84 
 
 		 444 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  44.89 
 
 		 444 aa  303  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  44.84 
 
 		 478 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  44.84 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  44.84 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  44.74 
 
 		 402 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  44.84 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  44.84 
 
 		 500 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  44.84 
 
 		 500 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  46.21 
 
 		 451 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  45.45 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  45.45 
 
 		 524 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  45.2 
 
 		 430 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  43.79 
 
 		 494 aa  300  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  44.36 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  45.79 
 
 		 457 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  43.26 
 
 		 433 aa  299  5e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  45.2 
 
 		 428 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  42.62 
 
 		 431 aa  298  9e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  47.81 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  43.68 
 
 		 399 aa  297  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  44.68 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  41.53 
 
 		 467 aa  296  4e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  43.42 
 
 		 461 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  45.69 
 
 		 424 aa  295  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  43.43 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  46.04 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  45.13 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  42.58 
 
 		 398 aa  294  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  43.13 
 
 		 428 aa  293  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1110  ammonium transporter  44.5 
 
 		 428 aa  293  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0348758  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>