More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0771 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0771  ammonium transporter  100 
 
 
396 aa  779    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00637331  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  64.1 
 
 
397 aa  500  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  59.69 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  57.69 
 
 
398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  60.93 
 
 
400 aa  464  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  58.52 
 
 
397 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  58.88 
 
 
402 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  58.54 
 
 
398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  56.57 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  50.5 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  51.79 
 
 
399 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  49 
 
 
405 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  48.49 
 
 
449 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  49.25 
 
 
408 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  49.25 
 
 
408 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  47.86 
 
 
457 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  47.54 
 
 
451 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  49.25 
 
 
408 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  48.06 
 
 
434 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  47.47 
 
 
464 aa  363  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  47.77 
 
 
467 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  47.38 
 
 
405 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  45.79 
 
 
410 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  47.12 
 
 
402 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  46.04 
 
 
410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  45.54 
 
 
410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  48.74 
 
 
461 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  46.04 
 
 
410 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  45.54 
 
 
410 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  45.19 
 
 
410 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  45.3 
 
 
410 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  45.3 
 
 
410 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  46.63 
 
 
436 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  45.3 
 
 
411 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  44.84 
 
 
489 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  46.6 
 
 
443 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  45.19 
 
 
488 aa  346  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  46.75 
 
 
462 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  46.46 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  44.95 
 
 
485 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  43.27 
 
 
515 aa  335  9e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  45.59 
 
 
429 aa  335  9e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  46.48 
 
 
402 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  43.27 
 
 
515 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  47.24 
 
 
401 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  46.63 
 
 
411 aa  332  7.000000000000001e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  42.76 
 
 
507 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  42.76 
 
 
496 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  46.75 
 
 
435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  47.49 
 
 
438 aa  325  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  47.49 
 
 
438 aa  325  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  45.86 
 
 
401 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  46.21 
 
 
431 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  44.72 
 
 
431 aa  318  7e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  43.92 
 
 
437 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  44.64 
 
 
437 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  45.05 
 
 
445 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  43.67 
 
 
437 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  43.92 
 
 
437 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  44.06 
 
 
432 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  45.64 
 
 
433 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  45.23 
 
 
444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  42.96 
 
 
466 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  40.7 
 
 
433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  42.72 
 
 
466 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  42.07 
 
 
405 aa  309  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  42.72 
 
 
466 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  43.77 
 
 
504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  43.84 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  42.31 
 
 
472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  44.01 
 
 
500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  42.75 
 
 
439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  46.15 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  44.44 
 
 
469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  43.58 
 
 
432 aa  306  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  47.84 
 
 
423 aa  305  9.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  44.2 
 
 
466 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  44.2 
 
 
500 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  44.2 
 
 
466 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  44.2 
 
 
500 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  44.2 
 
 
466 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  44.2 
 
 
444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  43.77 
 
 
500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  44.2 
 
 
478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  43.77 
 
 
500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  43.77 
 
 
500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  42.27 
 
 
463 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  43.22 
 
 
434 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  42.21 
 
 
405 aa  302  6.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  44.25 
 
 
470 aa  302  7.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  40.27 
 
 
521 aa  300  3e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  43.46 
 
 
499 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  43.5 
 
 
438 aa  299  5e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  43.64 
 
 
461 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  43.32 
 
 
502 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  44.33 
 
 
433 aa  296  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  44.5 
 
 
497 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  40.57 
 
 
470 aa  295  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  44.5 
 
 
503 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  44.28 
 
 
433 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>