More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4164 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
254 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1386  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  80.71 
 
 
263 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315902  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1402  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  80.31 
 
 
263 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1368  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  80.71 
 
 
263 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  77.95 
 
 
261 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64 
 
 
252 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4892  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.34 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.52 
 
 
269 aa  301  9e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.87 
 
 
255 aa  297  9e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0330  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.5 
 
 
257 aa  289  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.6 
 
 
254 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08500  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.92 
 
 
259 aa  286  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.494503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  58.66 
 
 
263 aa  285  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12526  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase alpha subunit scoA  61.2 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399784  normal  0.0529319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.04 
 
 
255 aa  281  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.84 
 
 
274 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.84 
 
 
250 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07610  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  60.23 
 
 
269 aa  278  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.05 
 
 
267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  55.91 
 
 
232 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.22 
 
 
240 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  54.37 
 
 
233 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  57.48 
 
 
232 aa  254  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.35 
 
 
233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.18 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.35 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  54.85 
 
 
237 aa  250  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.01 
 
 
233 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  49.8 
 
 
506 aa  248  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.6 
 
 
270 aa  248  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.79 
 
 
233 aa  247  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  54.43 
 
 
237 aa  247  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.97 
 
 
236 aa  246  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.97 
 
 
234 aa  244  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  53.56 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.99 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.21 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  54.85 
 
 
244 aa  242  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.57 
 
 
235 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0351  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.4 
 
 
236 aa  242  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.901849  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  53.56 
 
 
234 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  49 
 
 
519 aa  241  7e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.14 
 
 
234 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.14 
 
 
234 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  53.14 
 
 
234 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.57 
 
 
234 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.14 
 
 
234 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.14 
 
 
234 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  53.14 
 
 
234 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.59 
 
 
229 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  51.38 
 
 
238 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.3 
 
 
234 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1905  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  53.94 
 
 
235 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4266  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.93 
 
 
235 aa  234  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.367586  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  52.3 
 
 
234 aa  234  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.3 
 
 
234 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1914  3-ketoacid CoA transferase alpha subunit  50 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507414  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.57 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.57 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.54 
 
 
238 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.1 
 
 
235 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.99 
 
 
246 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.8 
 
 
243 aa  231  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.94 
 
 
238 aa  231  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.59 
 
 
235 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1706  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.15 
 
 
233 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  50.84 
 
 
242 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.54 
 
 
238 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17570  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  55.27 
 
 
232 aa  230  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1456  3-oxoacid CoA-transferase  54.24 
 
 
235 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0699745  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0959  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.27 
 
 
235 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248714  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.58 
 
 
245 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.78 
 
 
234 aa  228  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  47.98 
 
 
229 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.21 
 
 
233 aa  227  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
234 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  47.6 
 
 
253 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.15 
 
 
245 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  51.27 
 
 
329 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.45 
 
 
255 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1366  3-oxoacid CoA-transferase  52.36 
 
 
234 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.77 
 
 
239 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
234 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
234 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.78 
 
 
245 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.6 
 
 
234 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  49.6 
 
 
234 aa  225  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.43 
 
 
245 aa  224  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.43 
 
 
245 aa  224  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.58 
 
 
246 aa  224  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3950  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.58 
 
 
245 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49 
 
 
232 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.2 
 
 
234 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.2 
 
 
234 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01941  putative succinyl-CoA transferase, alpha subunit  46.99 
 
 
235 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546528  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3108  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.42 
 
 
232 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784994  normal  0.0838265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.2 
 
 
234 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.2 
 
 
234 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  50 
 
 
236 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>