More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3216 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  100 
 
 		 244 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  73.46 
 
 		 233 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  73.46 
 
 		 233 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  73.46 
 
 		 233 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  73.36 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  67.73 
 
 		 220 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  69.57 
 
 		 233 aa  299  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  68.7 
 
 		 233 aa  295  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  73.93 
 
 		 233 aa  293  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  69.43 
 
 		 233 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  67.74 
 
 		 237 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  61.86 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  58.19 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 228 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  57.51 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  55.6 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  55.56 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  56.03 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  58.6 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  54.98 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  54.31 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  55.6 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  54.7 
 
 		 240 aa  225  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  53.85 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  53.88 
 
 		 240 aa  224  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  55.26 
 
 		 233 aa  221  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  57.75 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  53.74 
 
 		 244 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  49.14 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  51.71 
 
 		 239 aa  211  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  57.21 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  50.64 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 307 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 273 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  32.92 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 265 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 277 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  29.38 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  33.03 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  33.03 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  32.5 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  34.98 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  29.41 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  28.95 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.61 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  35.05 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  32.38 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  31.7 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1095  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470095  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  29.72 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>