More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2256 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 218 aa  430  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  75.12 
 
 		 221 aa  315  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  75 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  75 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  75 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  75.7 
 
 		 221 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  69.95 
 
 		 229 aa  297  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  70.42 
 
 		 229 aa  297  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  69.12 
 
 		 217 aa  294  7e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  69.44 
 
 		 218 aa  293  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  67.74 
 
 		 220 aa  291  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  72.17 
 
 		 220 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  69.01 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  68.4 
 
 		 219 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  66.98 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  66.04 
 
 		 219 aa  275  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  63.68 
 
 		 223 aa  274  8e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  65.42 
 
 		 222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  63.24 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  61.79 
 
 		 231 aa  248  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  57.64 
 
 		 249 aa  247  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  62.26 
 
 		 259 aa  244  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  58.69 
 
 		 219 aa  243  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  56.25 
 
 		 225 aa  241  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  57.89 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  57.08 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  56.88 
 
 		 241 aa  238  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  54.93 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  54.46 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  52 
 
 		 231 aa  228  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  49.78 
 
 		 231 aa  226  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  52.97 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  48.86 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  51.63 
 
 		 226 aa  187  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  49.26 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  37.27 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  37.27 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  37.8 
 
 		 220 aa  141  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  35.98 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  35.16 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.03 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  37.9 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  31.16 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  30.28 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  31.43 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  30.73 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  30.28 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  33.49 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  34.78 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  29.86 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  29.27 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  29.68 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  29.49 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.85 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  32.14 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.27 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  31.37 
 
 		 445 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  33.17 
 
 		 449 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  30.1 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  31.05 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  30.52 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.02 
 
 		 443 aa  85.1  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31.38 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  30.45 
 
 		 630 aa  85.1  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.61 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  28.25 
 
 		 457 aa  82.4  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  29 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  31.16 
 
 		 458 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  27.11 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  27.62 
 
 		 462 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  35.03 
 
 		 445 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  30.22 
 
 		 628 aa  78.2  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  31.78 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  28.37 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  29.72 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  30.19 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  29.72 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  27.4 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  30.59 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  28.05 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0108  potassium transporter peripheral membrane component  28.91 
 
 		 462 aa  75.5  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  31.22 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  27.75 
 
 		 457 aa  75.1  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 620 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 		 626 aa  75.1  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  24.88 
 
 		 449 aa  72.8  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 465 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  28.76 
 
 		 448 aa  72  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  25.73 
 
 		 465 aa  72  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  27.4 
 
 		 469 aa  72  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  25.91 
 
 		 449 aa  72  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  27.15 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  28.5 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  24.76 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>