256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0108 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  75.7 
 
 
462 aa  718    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0108  potassium transporter peripheral membrane component  100 
 
 
462 aa  931    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  37.25 
 
 
450 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  30.72 
 
 
449 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 
458 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  32.82 
 
 
453 aa  219  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  30.94 
 
 
454 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  30.04 
 
 
450 aa  216  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  31.52 
 
 
449 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  30.67 
 
 
457 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
450 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  30.42 
 
 
465 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  30.24 
 
 
458 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  29.37 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  27.87 
 
 
467 aa  201  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  29.16 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  29.16 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  29.87 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  29.16 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  29.16 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  29.16 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  27.62 
 
 
458 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  28.94 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  28.94 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  28.94 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  28.94 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  28.94 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  28.94 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  28.94 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  28.94 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  30.52 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  28.94 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  28.91 
 
 
457 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.91 
 
 
457 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  29.5 
 
 
457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  30.06 
 
 
459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  29.59 
 
 
458 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4070  potassium transporter peripheral membrane component  31.5 
 
 
471 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000101925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.91 
 
 
457 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.02 
 
 
445 aa  196  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  30.02 
 
 
458 aa  196  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  30.02 
 
 
458 aa  196  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  30.02 
 
 
458 aa  196  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  29.11 
 
 
469 aa  196  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  29.59 
 
 
458 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  29.81 
 
 
458 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  27.37 
 
 
458 aa  193  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  28.94 
 
 
458 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  28.33 
 
 
457 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  29 
 
 
458 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  29.81 
 
 
458 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 
458 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  29.39 
 
 
469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  28.33 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  28.96 
 
 
469 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  29.74 
 
 
457 aa  190  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  28.35 
 
 
458 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  29.32 
 
 
469 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  29.32 
 
 
469 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  29.32 
 
 
469 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  28.2 
 
 
457 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  28.69 
 
 
469 aa  189  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  29.54 
 
 
469 aa  189  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.37 
 
 
457 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  29 
 
 
454 aa  189  9e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.42 
 
 
457 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  28.96 
 
 
469 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  29.32 
 
 
469 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  29.32 
 
 
469 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  27.98 
 
 
458 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  29.54 
 
 
469 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  29.32 
 
 
469 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  29.32 
 
 
469 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  29.32 
 
 
469 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  28.29 
 
 
458 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2218  potassium transporter peripheral membrane component  28.6 
 
 
446 aa  186  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000230921 
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  28.78 
 
 
454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  28.54 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  27.61 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  27.71 
 
 
457 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  28.38 
 
 
448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 
458 aa  182  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  28.08 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  28.27 
 
 
469 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  28.23 
 
 
457 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  29.78 
 
 
458 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  26.72 
 
 
458 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  26.94 
 
 
458 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  26.69 
 
 
467 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  26.57 
 
 
458 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  28.99 
 
 
458 aa  176  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  28.42 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  27.9 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  29.45 
 
 
485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  26.8 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 
454 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4544  potassium transporter peripheral membrane component  30.99 
 
 
492 aa  170  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2079  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 
458 aa  169  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 
457 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  28.08 
 
 
458 aa  167  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>