82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1244 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1244    100 
 
 		 2171 bp  4304    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  80.62 
 
 		 2199 bp  159  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  79.74 
 
 		 2148 bp  145  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  84.68 
 
 		 2256 bp  95.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  92.06 
 
 		 2175 bp  85.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  96 
 
 		 2157 bp  83.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  95.83 
 
 		 2529 bp  79.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  95.74 
 
 		 2259 bp  77.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  95.74 
 
 		 2277 bp  77.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  88.57 
 
 		 2154 bp  75.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  94 
 
 		 2232 bp  75.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  90.32 
 
 		 2337 bp  75.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  97.62 
 
 		 2223 bp  75.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  93.75 
 
 		 3468 bp  71.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  89.06 
 
 		 2208 bp  71.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  88.89 
 
 		 2265 bp  69.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  92.16 
 
 		 2952 bp  69.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  92.16 
 
 		 2940 bp  69.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2369    88.89 
 
 		 3548 bp  69.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182688  normal  0.675739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  88.89 
 
 		 2247 bp  69.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  92.16 
 
 		 2952 bp  69.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  89.66 
 
 		 2202 bp  67.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  88.71 
 
 		 2217 bp  67.9  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  92 
 
 		 2424 bp  67.9  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  90.57 
 
 		 2313 bp  65.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  93.33 
 
 		 2256 bp  65.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  93.33 
 
 		 2346 bp  65.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  95.12 
 
 		 2352 bp  65.9  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  85.71 
 
 		 2631 bp  65.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  88.52 
 
 		 2196 bp  65.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  88.33 
 
 		 2181 bp  63.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1710  MMPL domain protein  91.67 
 
 		 3153 bp  63.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  91.67 
 
 		 2253 bp  63.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  90.38 
 
 		 2286 bp  63.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  93.18 
 
 		 2199 bp  63.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  91.67 
 
 		 2136 bp  63.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  97.22 
 
 		 2232 bp  63.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5130    89.09 
 
 		 2379 bp  61.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  90.2 
 
 		 2907 bp  61.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  94.87 
 
 		 2172 bp  61.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  97.14 
 
 		 2283 bp  61.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  88.89 
 
 		 2565 bp  60  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  92.86 
 
 		 2445 bp  60  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  94.74 
 
 		 2154 bp  60  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  88.89 
 
 		 2376 bp  60  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  87.93 
 
 		 2526 bp  60  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  94.74 
 
 		 3927 bp  60  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  100 
 
 		 2250 bp  60  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  96.97 
 
 		 2304 bp  58  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  86.89 
 
 		 2310 bp  58  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  94.59 
 
 		 2232 bp  58  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  94.59 
 
 		 2232 bp  58  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  96.97 
 
 		 2304 bp  58  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  86.89 
 
 		 2310 bp  58  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  92.68 
 
 		 2211 bp  58  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  96.97 
 
 		 2232 bp  58  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  96.97 
 
 		 2304 bp  58  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  86.89 
 
 		 2172 bp  58  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  86.89 
 
 		 2256 bp  58  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  88.46 
 
 		 2214 bp  56  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  88.46 
 
 		 2937 bp  56  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  96.88 
 
 		 450 bp  56  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  84 
 
 		 2208 bp  54  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  88.24 
 
 		 2199 bp  54  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  94.29 
 
 		 2286 bp  54  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  89.36 
 
 		 2184 bp  54  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  89.36 
 
 		 2205 bp  54  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  96.67 
 
 		 2223 bp  52  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  90.48 
 
 		 2214 bp  52  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  92.11 
 
 		 2223 bp  52  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  88 
 
 		 2331 bp  52  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  96.67 
 
 		 3009 bp  52  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  96.67 
 
 		 2763 bp  52  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  90.48 
 
 		 2385 bp  52  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  92.11 
 
 		 2214 bp  52  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  89.13 
 
 		 2133 bp  52  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  88 
 
 		 2544 bp  52  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  92.11 
 
 		 3333 bp  52  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  88.89 
 
 		 2181 bp  50.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  90.24 
 
 		 2208 bp  50.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  93.94 
 
 		 2499 bp  50.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  96.55 
 
 		 2391 bp  50.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>