27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4976 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  290  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  41.27 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  39.49 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5367  hypothetical protein  40.35 
 
 
245 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.66384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  34.42 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10370  hypothetical protein  35.86 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0477312 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  37.23 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0264  hypothetical protein  36.57 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  36.88 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  38.46 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0851  hypothetical protein  34.56 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398648  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  34.06 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  38.74 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  35.88 
 
 
167 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  32.43 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  39.06 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  35.88 
 
 
155 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1626  hypothetical protein  33.93 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.34451  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  35.11 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  35.11 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  37.93 
 
 
323 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  36.11 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  34.71 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  30.51 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1353  hypothetical protein  29.09 
 
 
168 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11350  hypothetical protein  29.82 
 
 
122 aa  41.2  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  29.03 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>