30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1716 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  301  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  58.22 
 
 
154 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  61.87 
 
 
154 aa  163  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  51.61 
 
 
154 aa  156  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  55 
 
 
155 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  60.98 
 
 
167 aa  147  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  59.02 
 
 
146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  46.27 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  56.8 
 
 
323 aa  120  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  46.04 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  47.06 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  39.86 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  46.97 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  43.24 
 
 
155 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  41.01 
 
 
153 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  43.24 
 
 
155 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  43.24 
 
 
155 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1251  hypothetical protein  41.26 
 
 
162 aa  98.2  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  38.46 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  33.06 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  39.02 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  38.13 
 
 
149 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  31.2 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4032  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  36.43 
 
 
134 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2765  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.183145  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  35.16 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10370  hypothetical protein  32.65 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0477312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4711  hypothetical protein  36.05 
 
 
164 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17292  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1626  hypothetical protein  31.01 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.34451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>