27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1893 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  617  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  61.36 
 
 		 154 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  61.31 
 
 		 155 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  59.29 
 
 		 154 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  65.15 
 
 		 154 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  58.27 
 
 		 153 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  59.48 
 
 		 169 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  60.53 
 
 		 146 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  57.02 
 
 		 167 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  48.51 
 
 		 156 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  49.61 
 
 		 154 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  51.97 
 
 		 156 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  50.81 
 
 		 153 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  46.88 
 
 		 155 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  46.88 
 
 		 155 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  46.88 
 
 		 155 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  42.34 
 
 		 161 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1251  hypothetical protein  44.93 
 
 		 162 aa  86.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  44.35 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  34.19 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  34.09 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  36.67 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  42.5 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10370  hypothetical protein  36.21 
 
 		 198 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0477312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4032  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  34.65 
 
 		 134 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>