29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3478 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  303  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  78.15 
 
 		 154 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  56.15 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  58.82 
 
 		 167 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  49.32 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  52.99 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  51.15 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  55.37 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  48.23 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  45.77 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  44.08 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  43.42 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  43.42 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  53.23 
 
 		 323 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  44.36 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  37.98 
 
 		 161 aa  90.1  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  44.14 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1251  hypothetical protein  36.49 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4032  hypothetical protein  35.51 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  31.45 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1353  hypothetical protein  27.91 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  30.17 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  38.02 
 
 		 132 aa  50.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  34.75 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5367  hypothetical protein  35.65 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.66384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  37.39 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2765  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.183145  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>