27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4233 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  307  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  307  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  98.71 
 
 
155 aa  304  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  59.33 
 
 
155 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  48.57 
 
 
154 aa  126  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  54.67 
 
 
155 aa  124  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  49.22 
 
 
154 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  47.97 
 
 
155 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  47.11 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  47.71 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  42.76 
 
 
154 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  43.42 
 
 
156 aa  103  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  44.96 
 
 
154 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  43.97 
 
 
153 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  46.02 
 
 
167 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  38.84 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  46.88 
 
 
323 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  35.86 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  34.71 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1251  hypothetical protein  38.85 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  30.65 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10370  hypothetical protein  35.14 
 
 
198 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0477312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4032  hypothetical protein  33.91 
 
 
166 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  35.11 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  36 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  33.61 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  28.1 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>