34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0838 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  249  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  41.09 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  41.43 
 
 
154 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1626  hypothetical protein  44.35 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.34451  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  36.62 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  35.92 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1353  hypothetical protein  34.01 
 
 
168 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2765  TonB-dependent siderophore receptor  42.06 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.183145  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  39.47 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  35.38 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  37.29 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  38.33 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  41.86 
 
 
323 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  37.3 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  36.72 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  36.8 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  39.32 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  33.06 
 
 
153 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  36 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  35.97 
 
 
161 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  36 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1251  hypothetical protein  46.05 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  38.02 
 
 
156 aa  53.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  33.88 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  37.5 
 
 
134 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  44.62 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  35.94 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1590  hypothetical protein  31.82 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17101  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10370  hypothetical protein  34.62 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0477312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3022  hypothetical protein  31.52 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1467  hypothetical protein  29.52 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00055805 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0264  hypothetical protein  35.78 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  35.45 
 
 
155 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1110  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>